RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394450.6

PRELID2-202, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRELID2, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-202ENST00000394450 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.62■■■■■ 5.21
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.61■■■■■ 5.21
PRELID2-202ENST00000394450 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.61■■■■■ 5.21
PRELID2-202ENST00000394450 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.59■■■■■ 5.21
PRELID2-202ENST00000394450 ADAMTSL3P82987 1691 aa47.57■■■■■ 5.21
PRELID2-202ENST00000394450 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.53■■■■■ 5.2
PRELID2-202ENST00000394450 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.51■■■■■ 5.2
PRELID2-202ENST00000394450 HECW2Q9P2P5 1572 aa47.49■■■■■ 5.19
PRELID2-202ENST00000394450 PTPRMP28827 1452 aa47.48■■■■■ 5.19
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa47.44■■■■■ 5.18
PRELID2-202ENST00000394450 MYT1LQ9UL68 1186 aa47.4■■■■■ 5.18
PRELID2-202ENST00000394450 MADDQ8WXG6 1647 aa47.4■■■■■ 5.18
PRELID2-202ENST00000394450 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.38■■■■■ 5.18
PRELID2-202ENST00000394450 AFAP1Q8N556 730 aa47.37■■■■■ 5.17
PRELID2-202ENST00000394450 PREX2Q70Z35 1606 aa47.37■■■■■ 5.17
PRELID2-202ENST00000394450 ATP10AO60312 1499 aa47.34■■■■■ 5.17
PRELID2-202ENST00000394450 CEP162Q5TB80 1403 aa47.33■■■■■ 5.17
PRELID2-202ENST00000394450 C9orf84Q5VXU9 1444 aa47.3■■■■■ 5.16
PRELID2-202ENST00000394450 MLECQ14165 292 aa47.3■■■■■ 5.16
PRELID2-202ENST00000394450 KDM5CP41229 1560 aa47.26■■■■■ 5.16
PRELID2-202ENST00000394450 MTUS2Q5JR59 1369 aa47.25■■■■■ 5.16
PRELID2-202ENST00000394450 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
PRELID2-202ENST00000394450 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.23■■■■■ 5.15
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC1P33527 1531 aa47.23■■■■■ 5.15
PRELID2-202ENST00000394450 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.21■■■■■ 5.15
PRELID2-202ENST00000394450 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa47.16■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 MLH3Q9UHC1 1453 aa47.15■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.15■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa47.15■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 CCNB3Q8WWL7 1395 aa47.14■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 ITSN2Q9NZM3 1697 aa47.13■■■■■ 5.14
PRELID2-202ENST00000394450 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
PRELID2-202ENST00000394450 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.07■■■■■ 5.13
PRELID2-202ENST00000394450 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa47.07■■■■■ 5.12
PRELID2-202ENST00000394450 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa47.06■■■■■ 5.12
PRELID2-202ENST00000394450 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa47.03■■■■■ 5.12
PRELID2-202ENST00000394450 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa47.02■■■■■ 5.12
PRELID2-202ENST00000394450 ABCA6Q8N139 1617 aa47■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa47■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 REREQ9P2R6 1566 aa46.99■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.99■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.98■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.96■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
PRELID2-202ENST00000394450 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.94■■■■■ 5.1
PRELID2-202ENST00000394450 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.91■■■■■ 5.1
PRELID2-202ENST00000394450 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
PRELID2-202ENST00000394450 AGLP35573 1532 aa46.88■■■■■ 5.09
PRELID2-202ENST00000394450 TIAM1Q13009 1591 aa46.85■■■■■ 5.09
PRELID2-202ENST00000394450 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.83■■■■■ 5.09
PRELID2-202ENST00000394450 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
PRELID2-202ENST00000394450 HSPA2P54652 639 aa46.76■■■■■ 5.08
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
PRELID2-202ENST00000394450 ATP7AQ04656 1500 aa46.75■■■■■ 5.07
PRELID2-202ENST00000394450 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
PRELID2-202ENST00000394450 NCOA2Q15596 1464 aa46.73■■■■■ 5.07
PRELID2-202ENST00000394450 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
PRELID2-202ENST00000394450 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
PRELID2-202ENST00000394450 CNTLNQ9NXG0 1405 aa46.64■■■■■ 5.06
PRELID2-202ENST00000394450 A2MP01023 1474 aa46.63■■■■■ 5.05
PRELID2-202ENST00000394450 MBD5Q9P267 1494 aa46.63■■■■■ 5.05
PRELID2-202ENST00000394450 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.61■■■■■ 5.05
PRELID2-202ENST00000394450 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.6■■■■■ 5.05
PRELID2-202ENST00000394450 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.57■■■■■ 5.05
PRELID2-202ENST00000394450 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46.55■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 C3P01024 1663 aa46.54■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.54■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.53■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 MAP3K1Q13233 1512 aa46.52■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 PLXNC1O60486 1568 aa46.51■■■■■ 5.04
PRELID2-202ENST00000394450 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.5■■■■■ 5.03
PRELID2-202ENST00000394450 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.49■■■■■ 5.03
PRELID2-202ENST00000394450 GGT6Q6P531 493 aa46.48■■■■■ 5.03
PRELID2-202ENST00000394450 APLP2Q06481 763 aa46.47■■■■■ 5.03
PRELID2-202ENST00000394450 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
PRELID2-202ENST00000394450 TSPY4P0CV99 314 aa46.41■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 TSPY10P0CW01 314 aa46.41■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 ZMYM3Q14202 1370 aa46.41■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 MROH2AA6NES4 1674 aa46.39■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 PPP6R1Q9UPN7 881 aa46.39■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
PRELID2-202ENST00000394450 DMRT2Q9Y5R5 561 aa46.33■■■■■ 5.01
PRELID2-202ENST00000394450 NPATQ14207 1427 aa46.33■■■■■ 5.01
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.33■■■■■ 5.01
PRELID2-202ENST00000394450 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
PRELID2-202ENST00000394450 FBXO41Q8TF61 875 aa46.29■■■■■ 5
PRELID2-202ENST00000394450 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.28■■■■■ 5
PRELID2-202ENST00000394450 KIF3BO15066 747 aa46.27■■■■■ 5
PRELID2-202ENST00000394450 MIA2Q96PC5 1412 aa46.27■■■■■ 5
PRELID2-202ENST00000394450 STRCQ7RTU9 1775 aa46.14■■■■■ 4.98
PRELID2-202ENST00000394450 PTPRKQ15262 1439 aa46.13■■■■■ 4.98
PRELID2-202ENST00000394450 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa46.08■■■■■ 4.97
PRELID2-202ENST00000394450 MAST1Q9Y2H9 1570 aa46.08■■■■■ 4.97
PRELID2-202ENST00000394450 CERKQ8TCT0 537 aa46.07■■■■■ 4.97
PRELID2-202ENST00000394450 FAM135AQ9P2D6 1515 aa46.05■■■■■ 4.96
PRELID2-202ENST00000394450 PTPRTO14522 1441 aa46.03■■■■■ 4.96
PRELID2-202ENST00000394450 KDM5DQ9BY66 1539 aa46.03■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms