RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384128.1

RNU6-571P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 571, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-571P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-571P-201ENST00000384128 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-571P-201ENST00000384128 PHF8Q9UPP1 1060 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-571P-201ENST00000384128 PTGER2P43116 358 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 SPOCK2Q92563 424 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 AXIN2Q9Y2T1 843 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 NUDT7P0C024 238 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 LHX6Q9UPM6 363 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 KIF3CO14782 793 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 SOX12O15370 315 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 FBXO22Q8NEZ5 403 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-571P-201ENST00000384128 C2orf72A6NCS6 295 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 PBX2P40425 430 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 HCSTQ9UBK5 93 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 DMRTA1Q5VZB9 504 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 PSEN2P49810 448 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 VGFO15240 615 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 HRO43593 1189 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 TRIM41Q8WV44 630 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 MFRPQ9BY79 579 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 ARHGAP33O14559 1287 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 NLRP6P59044 892 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 SLC34A2O95436 690 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-571P-201ENST00000384128 STK24Q9Y6E0 443 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 TK2O00142 265 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 PTPN5P54829 565 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 PPP1R37O75864 691 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 TMC2Q8TDI7 906 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 A0A0G2JS52 829 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 KCNK17Q96T54 332 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 STK25O00506 426 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-571P-201ENST00000384128 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 PLPP6Q8IY26 295 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 LCE2BO14633 110 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 DSG2Q14126 1118 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 IFFO2Q5TF58 517 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 RGS20O76081 388 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 FOXK1P85037 733 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 STAC3Q96MF2 364 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 RGL2O15211 777 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZNF454Q8N9F8 522 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 Q6ZNB5 142 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 WNT2BQ93097 391 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZBED2Q9BTP6 218 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 OXER1Q8TDS5 423 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 SLC4A5Q9BY07 1137 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 BCL2L12Q9HB09 334 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 FOSBP53539 338 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 KCNH8Q96L42 1107 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 TAOK2Q9UL54 1235 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-571P-201ENST00000384128 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 TBC1D12O60347 775 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PTPREP23469 700 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 BCAMP50895 628 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PKD2Q13563 968 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 ADAM33Q9BZ11 813 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PROX2Q3B8N5 592 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 COL9A1P20849 921 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 JPH4Q96JJ6 628 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZDHHC16Q969W1 377 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 NBPF3Q9H094 633 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 EVI5O60447 810 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 WBP1LQ9NX94 342 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 SOWAHBA6NEL2 793 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-571P-201ENST00000384128 GFRA3O60609 400 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-571P-201ENST00000384128 KCNC4Q03721 635 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-571P-201ENST00000384128 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-571P-201ENST00000384128 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-571P-201ENST00000384128 HS6ST3Q8IZP7 471 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-571P-201ENST00000384128 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms