RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380716.8

PSIP1-202, Transcript of PC4 and SFRS1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSIP1, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSIP1-202ENST00000380716 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.41■■■■□ 3.1
PSIP1-202ENST00000380716 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.38■■■■□ 3.09
PSIP1-202ENST00000380716 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
PSIP1-202ENST00000380716 PLCH2O75038 1416 aa34.35■■■■□ 3.09
PSIP1-202ENST00000380716 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.34■■■■□ 3.09
PSIP1-202ENST00000380716 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
PSIP1-202ENST00000380716 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PSIP1-202ENST00000380716 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.27■■■■□ 3.08
PSIP1-202ENST00000380716 DAPK1P53355 1430 aa34.26■■■■□ 3.08
PSIP1-202ENST00000380716 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.25■■■■□ 3.07
PSIP1-202ENST00000380716 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.25■■■■□ 3.07
PSIP1-202ENST00000380716 PTPRKQ15262 1439 aa34.22■■■■□ 3.07
PSIP1-202ENST00000380716 ABCC5O15440 1437 aa34.21■■■■□ 3.07
PSIP1-202ENST00000380716 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.2■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.18■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 CD109Q6YHK3 1445 aa34.18■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.18■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 GLI2P10070 1586 aa34.17■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 FANCAO15360 1455 aa34.17■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.16■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.15■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.15■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 AKNAQ7Z591 1439 aa34.14■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.14■■■■□ 3.06
PSIP1-202ENST00000380716 MBD5Q9P267 1494 aa34.13■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 HFM1A2PYH4 1435 aa34.13■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.12■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 DIP2BQ9P265 1576 aa34.12■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.12■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 ABCC1P33527 1531 aa34.12■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.12■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 ROCK1Q13464 1354 aa34.11■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.1■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.1■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.09■■■■□ 3.05
PSIP1-202ENST00000380716 TSPY4P0CV99 314 aa34.07■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 TSPY10P0CW01 314 aa34.07■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.06■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.05■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 NAIPQ13075 1403 aa34.04■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 ADGRL2O95490 1459 aa34.03■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.03■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.03■■■■□ 3.04
PSIP1-202ENST00000380716 ADGRL1O94910 1474 aa34.01■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 HRCP23327 699 aa34■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.99■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 NEO1Q92859 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.97■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 NCOA1Q15788 1441 aa33.97■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PSIP1-202ENST00000380716 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.93■■■■□ 3.02
PSIP1-202ENST00000380716 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.92■■■■□ 3.02
PSIP1-202ENST00000380716 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.91■■■■□ 3.02
PSIP1-202ENST00000380716 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.87■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 PLXNC1O60486 1568 aa33.85■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.85■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 TSPOAP1O95153 1857 aa33.83■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 KIF15Q9NS87 1388 aa33.83■■■■□ 3.01
PSIP1-202ENST00000380716 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.82■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 AFAP1Q8N556 730 aa33.81■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.8■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.78■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.78■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 KDM6BO15054 1643 aa33.77■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
PSIP1-202ENST00000380716 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 ATP7AQ04656 1500 aa33.75■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 KDM5CP41229 1560 aa33.74■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.71■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.71■■■□□ 2.99
PSIP1-202ENST00000380716 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.67■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 RICTORQ6R327 1708 aa33.66■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.66■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 TRIM52Q96A61 297 aa33.65■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.65■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 ERBINQ96RT1 1412 aa33.65■■■□□ 2.98
PSIP1-202ENST00000380716 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.63■■■□□ 2.97
PSIP1-202ENST00000380716 RAPGEF3O95398 923 aa33.61■■■□□ 2.97
PSIP1-202ENST00000380716 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
PSIP1-202ENST00000380716 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.56■■■□□ 2.96
PSIP1-202ENST00000380716 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.54■■■□□ 2.96
PSIP1-202ENST00000380716 UNC13BO14795 1591 aa33.5■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.5■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.48■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.48■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 ABCA6Q8N139 1617 aa33.47■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 NUP155O75694 1391 aa33.47■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 A2MP01023 1474 aa33.46■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
PSIP1-202ENST00000380716 PZPP20742 1482 aa33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms