RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380272.3

FAM50B-201, Transcript of family with sequence similarity 50 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM50B, Length 1,628 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50B-201ENST00000380272 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.13■■□□□ 1.93
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FAM50B-201ENST00000380272 ITGAEP38570 1179 aa27.11■■□□□ 1.93
FAM50B-201ENST00000380272 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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FAM50B-201ENST00000380272 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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FAM50B-201ENST00000380272 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.02■■□□□ 1.92
FAM50B-201ENST00000380272 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27■■□□□ 1.91
FAM50B-201ENST00000380272 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.97■■□□□ 1.91
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FAM50B-201ENST00000380272 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
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FAM50B-201ENST00000380272 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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FAM50B-201ENST00000380272 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.68■■□□□ 1.86
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FAM50B-201ENST00000380272 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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FAM50B-201ENST00000380272 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM50B-201ENST00000380272 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.61■■□□□ 1.85
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FAM50B-201ENST00000380272 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.59■■□□□ 1.85
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FAM50B-201ENST00000380272 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.56■■□□□ 1.84
FAM50B-201ENST00000380272 ABCC5O15440 1437 aa26.56■■□□□ 1.84
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FAM50B-201ENST00000380272 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.54■■□□□ 1.84
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FAM50B-201ENST00000380272 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.54■■□□□ 1.84
FAM50B-201ENST00000380272 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
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FAM50B-201ENST00000380272 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.49■■□□□ 1.83
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FAM50B-201ENST00000380272 ADGRL2O95490 1459 aa26.39■■□□□ 1.82
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FAM50B-201ENST00000380272 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
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FAM50B-201ENST00000380272 NCOA1Q15788 1441 aa26.36■■□□□ 1.81
FAM50B-201ENST00000380272 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.35■■□□□ 1.81
FAM50B-201ENST00000380272 REREQ9P2R6 1566 aa26.35■■□□□ 1.81
FAM50B-201ENST00000380272 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.35■■□□□ 1.81
FAM50B-201ENST00000380272 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.34■■□□□ 1.81
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FAM50B-201ENST00000380272 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM50B-201ENST00000380272 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.32■■□□□ 1.8
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