RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379567.6

AP5S1-202, Transcript of adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AP5S1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1-202ENST00000379567 PREX2Q70Z35 1606 aa28.75■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.74■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.74■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.74■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.73■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.73■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.72■■■□□ 2.19
AP5S1-202ENST00000379567 KDM6BO15054 1643 aa28.7■■■□□ 2.18
AP5S1-202ENST00000379567 AKNAQ7Z591 1439 aa28.69■■■□□ 2.18
AP5S1-202ENST00000379567 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.69■■■□□ 2.18
AP5S1-202ENST00000379567 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
AP5S1-202ENST00000379567 ADGRL1O94910 1474 aa28.63■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.59■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.58■■■□□ 2.17
AP5S1-202ENST00000379567 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.56■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC1P33527 1531 aa28.54■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 RAPGEF3O95398 923 aa28.54■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 MIA2Q96PC5 1412 aa28.54■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.53■■■□□ 2.16
AP5S1-202ENST00000379567 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.5■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.49■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.49■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.48■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 RICTORQ6R327 1708 aa28.48■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.48■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.47■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.46■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
AP5S1-202ENST00000379567 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 AFAP1Q8N556 730 aa28.42■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.41■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.4■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 MBD5Q9P267 1494 aa28.39■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 KDM5CP41229 1560 aa28.39■■■□□ 2.14
AP5S1-202ENST00000379567 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
AP5S1-202ENST00000379567 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.36■■■□□ 2.13
AP5S1-202ENST00000379567 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.35■■■□□ 2.13
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.34■■■□□ 2.13
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.34■■■□□ 2.13
AP5S1-202ENST00000379567 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.32■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.32■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.31■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.3■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.27■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.27■■■□□ 2.12
AP5S1-202ENST00000379567 TSPY4P0CV99 314 aa28.26■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 TSPY10P0CW01 314 aa28.26■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 ATP7AQ04656 1500 aa28.24■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.23■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.22■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC5O15440 1437 aa28.21■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 DAPK1P53355 1430 aa28.21■■■□□ 2.11
AP5S1-202ENST00000379567 ABCA6Q8N139 1617 aa28.19■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.18■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 ATP10AO60312 1499 aa28.18■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.18■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.18■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.17■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.17■■■□□ 2.1
AP5S1-202ENST00000379567 REREQ9P2R6 1566 aa28.1■■■□□ 2.09
AP5S1-202ENST00000379567 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.09■■■□□ 2.09
AP5S1-202ENST00000379567 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.09■■■□□ 2.09
AP5S1-202ENST00000379567 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
AP5S1-202ENST00000379567 ITGAEP38570 1179 aa28.08■■■□□ 2.09
AP5S1-202ENST00000379567 A2MP01023 1474 aa28.07■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 PLXNC1O60486 1568 aa28.07■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.05■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 PTPRKQ15262 1439 aa28.05■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.04■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 ADGRL2O95490 1459 aa28.02■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
AP5S1-202ENST00000379567 NCOA1Q15788 1441 aa28.01■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 KIF15Q9NS87 1388 aa28.01■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.01■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 AGLP35573 1532 aa28■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.97■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 ROCK1Q13464 1354 aa27.97■■■□□ 2.07
AP5S1-202ENST00000379567 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.94■■■□□ 2.06
AP5S1-202ENST00000379567 MLECQ14165 292 aa27.94■■■□□ 2.06
AP5S1-202ENST00000379567 ERBINQ96RT1 1412 aa27.91■■■□□ 2.06
AP5S1-202ENST00000379567 KIF3BO15066 747 aa27.9■■■□□ 2.06
AP5S1-202ENST00000379567 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
AP5S1-202ENST00000379567 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.86■■■□□ 2.05
AP5S1-202ENST00000379567 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.86■■■□□ 2.05
AP5S1-202ENST00000379567 GGT6Q6P531 493 aa27.86■■■□□ 2.05
AP5S1-202ENST00000379567 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms