RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.21■■■■■ 4.19
FAAP20-202ENST00000378546 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.18■■■■■ 4.18
FAAP20-202ENST00000378546 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.18■■■■■ 4.18
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.15■■■■■ 4.18
FAAP20-202ENST00000378546 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.15■■■■■ 4.18
FAAP20-202ENST00000378546 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.11■■■■■ 4.17
FAAP20-202ENST00000378546 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.1■■■■■ 4.17
FAAP20-202ENST00000378546 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.09■■■■■ 4.17
FAAP20-202ENST00000378546 PREX2Q70Z35 1606 aa41.06■■■■■ 4.16
FAAP20-202ENST00000378546 MADDQ8WXG6 1647 aa41.06■■■■■ 4.16
FAAP20-202ENST00000378546 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.05■■■■■ 4.16
FAAP20-202ENST00000378546 PTPRMP28827 1452 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.01■■■■■ 4.16
FAAP20-202ENST00000378546 CEP162Q5TB80 1403 aa40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-202ENST00000378546 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-202ENST00000378546 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-202ENST00000378546 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-202ENST00000378546 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.93■■■■■ 4.14
FAAP20-202ENST00000378546 KDM5CP41229 1560 aa40.91■■■■■ 4.14
FAAP20-202ENST00000378546 ABCC1P33527 1531 aa40.9■■■■■ 4.14
FAAP20-202ENST00000378546 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.89■■■■■ 4.14
FAAP20-202ENST00000378546 ATP10AO60312 1499 aa40.89■■■■■ 4.14
FAAP20-202ENST00000378546 AFAP1Q8N556 730 aa40.88■■■■■ 4.13
FAAP20-202ENST00000378546 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.87■■■■■ 4.13
FAAP20-202ENST00000378546 MLECQ14165 292 aa40.86■■■■■ 4.13
FAAP20-202ENST00000378546 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.86■■■■■ 4.13
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.81■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.79■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.77■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.77■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.76■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
FAAP20-202ENST00000378546 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.74■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.73■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA6Q8N139 1617 aa40.73■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.72■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.7■■■■■ 4.11
FAAP20-202ENST00000378546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-202ENST00000378546 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-202ENST00000378546 REREQ9P2R6 1566 aa40.64■■■■■ 4.1
FAAP20-202ENST00000378546 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-202ENST00000378546 TIAM1Q13009 1591 aa40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-202ENST00000378546 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.58■■■■■ 4.09
FAAP20-202ENST00000378546 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
FAAP20-202ENST00000378546 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.53■■■■■ 4.08
FAAP20-202ENST00000378546 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-202ENST00000378546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-202ENST00000378546 AGLP35573 1532 aa40.5■■■■■ 4.07
FAAP20-202ENST00000378546 ATP7AQ04656 1500 aa40.48■■■■■ 4.07
FAAP20-202ENST00000378546 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
FAAP20-202ENST00000378546 NCOA2Q15596 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
FAAP20-202ENST00000378546 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
FAAP20-202ENST00000378546 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
FAAP20-202ENST00000378546 HSPA2P54652 639 aa40.38■■■■■ 4.05
FAAP20-202ENST00000378546 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.37■■■■■ 4.05
FAAP20-202ENST00000378546 C3P01024 1663 aa40.31■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 A2MP01023 1474 aa40.31■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.31■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.3■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 MBD5Q9P267 1494 aa40.29■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.28■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 PLXNC1O60486 1568 aa40.27■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.27■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-202ENST00000378546 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-202ENST00000378546 MAP3K1Q13233 1512 aa40.21■■■■■ 4.03
FAAP20-202ENST00000378546 MROH2AA6NES4 1674 aa40.18■■■■■ 4.02
FAAP20-202ENST00000378546 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.17■■■■■ 4.02
FAAP20-202ENST00000378546 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
FAAP20-202ENST00000378546 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
FAAP20-202ENST00000378546 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
FAAP20-202ENST00000378546 GGT6Q6P531 493 aa40.13■■■■■ 4.01
FAAP20-202ENST00000378546 APLP2Q06481 763 aa40.12■■■■■ 4.01
FAAP20-202ENST00000378546 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-202ENST00000378546 ZMYM3Q14202 1370 aa40.05■■■■■ 4
FAAP20-202ENST00000378546 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.03■■■■■ 4
FAAP20-202ENST00000378546 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
FAAP20-202ENST00000378546 TSPY4P0CV99 314 aa40.02■■■■■ 4
FAAP20-202ENST00000378546 TSPY10P0CW01 314 aa40.02■■■■■ 4
FAAP20-202ENST00000378546 NPATQ14207 1427 aa40■■■■□ 3.99
FAAP20-202ENST00000378546 MIA2Q96PC5 1412 aa39.97■■■■□ 3.99
FAAP20-202ENST00000378546 KIF3BO15066 747 aa39.95■■■■□ 3.99
FAAP20-202ENST00000378546 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.94■■■■□ 3.98
FAAP20-202ENST00000378546 STRCQ7RTU9 1775 aa39.94■■■■□ 3.98
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO41Q8TF61 875 aa39.89■■■■□ 3.98
FAAP20-202ENST00000378546 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.89■■■■□ 3.98
FAAP20-202ENST00000378546 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.89■■■■□ 3.98
FAAP20-202ENST00000378546 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.88■■■■□ 3.97
FAAP20-202ENST00000378546 PTPRKQ15262 1439 aa39.85■■■■□ 3.97
FAAP20-202ENST00000378546 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.85■■■■□ 3.97
FAAP20-202ENST00000378546 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.81■■■■□ 3.96
FAAP20-202ENST00000378546 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.81■■■■□ 3.96
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms