RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.7■■■□□ 2.19
SYP-202ENST00000376303 PTPRMP28827 1452 aa28.7■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.69■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.68■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.68■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 MADDQ8WXG6 1647 aa28.65■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.64■■■□□ 2.18
SYP-202ENST00000376303 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.62■■■□□ 2.17
SYP-202ENST00000376303 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.6■■■□□ 2.17
SYP-202ENST00000376303 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.59■■■□□ 2.17
SYP-202ENST00000376303 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SYP-202ENST00000376303 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.57■■■□□ 2.16
SYP-202ENST00000376303 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.56■■■□□ 2.16
SYP-202ENST00000376303 PREX2Q70Z35 1606 aa28.54■■■□□ 2.16
SYP-202ENST00000376303 ATP10AO60312 1499 aa28.53■■■□□ 2.16
SYP-202ENST00000376303 KDM5CP41229 1560 aa28.51■■■□□ 2.15
SYP-202ENST00000376303 AFAP1Q8N556 730 aa28.49■■■□□ 2.15
SYP-202ENST00000376303 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.49■■■□□ 2.15
SYP-202ENST00000376303 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.48■■■□□ 2.15
SYP-202ENST00000376303 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.47■■■□□ 2.15
SYP-202ENST00000376303 MLECQ14165 292 aa28.45■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 ABCC1P33527 1531 aa28.43■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.42■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.42■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.4■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.4■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.4■■■□□ 2.14
SYP-202ENST00000376303 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.38■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.38■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 REREQ9P2R6 1566 aa28.37■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.35■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 ABCA6Q8N139 1617 aa28.35■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SYP-202ENST00000376303 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.32■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 CEP162Q5TB80 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.31■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.31■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.27■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 AGLP35573 1532 aa28.27■■■□□ 2.12
SYP-202ENST00000376303 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.26■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.23■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.23■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 HSPA2P54652 639 aa28.21■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.21■■■□□ 2.11
SYP-202ENST00000376303 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
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SYP-202ENST00000376303 TIAM1Q13009 1591 aa28.17■■■□□ 2.1
SYP-202ENST00000376303 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SYP-202ENST00000376303 ATP7AQ04656 1500 aa28.14■■■□□ 2.1
SYP-202ENST00000376303 C3P01024 1663 aa28.13■■■□□ 2.09
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SYP-202ENST00000376303 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.08■■■□□ 2.09
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SYP-202ENST00000376303 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 FBXO41Q8TF61 875 aa28.06■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 PLXNC1O60486 1568 aa28.05■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 A2MP01023 1474 aa28.05■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 NCOA2Q15596 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 MBD5Q9P267 1494 aa28.04■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 MROH2AA6NES4 1674 aa28.03■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.03■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.03■■■□□ 2.08
SYP-202ENST00000376303 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28■■■□□ 2.07
SYP-202ENST00000376303 STRCQ7RTU9 1775 aa27.97■■■□□ 2.07
SYP-202ENST00000376303 ZMYM3Q14202 1370 aa27.96■■■□□ 2.07
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SYP-202ENST00000376303 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.95■■■□□ 2.06
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SYP-202ENST00000376303 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.94■■■□□ 2.06
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SYP-202ENST00000376303 GGT6Q6P531 493 aa27.93■■■□□ 2.06
SYP-202ENST00000376303 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.93■■■□□ 2.06
SYP-202ENST00000376303 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.92■■■□□ 2.06
SYP-202ENST00000376303 MAP3K1Q13233 1512 aa27.91■■■□□ 2.06
SYP-202ENST00000376303 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.86■■■□□ 2.05
SYP-202ENST00000376303 CERKQ8TCT0 537 aa27.85■■■□□ 2.05
SYP-202ENST00000376303 TSPY4P0CV99 314 aa27.82■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 TSPY10P0CW01 314 aa27.82■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 PTPRTO14522 1441 aa27.82■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 PTPRKQ15262 1439 aa27.81■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 NCOA1Q15788 1441 aa27.79■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 KIF3BO15066 747 aa27.79■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.77■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 MIA2Q96PC5 1412 aa27.76■■■□□ 2.04
SYP-202ENST00000376303 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.75■■■□□ 2.03
SYP-202ENST00000376303 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.75■■■□□ 2.03
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