RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375599.7

RSG1-201, Transcript of REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSG1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1-201ENST00000375599 AKNAQ7Z591 1439 aa43.56■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 NCOA2Q15596 1464 aa43.56■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 PREX2Q70Z35 1606 aa43.55■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.53■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.51■■■■■ 4.56
RSG1-201ENST00000375599 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
RSG1-201ENST00000375599 ADGRL1O94910 1474 aa43.43■■■■■ 4.54
RSG1-201ENST00000375599 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.41■■■■■ 4.54
RSG1-201ENST00000375599 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
RSG1-201ENST00000375599 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.54
RSG1-201ENST00000375599 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.38■■■■■ 4.53
RSG1-201ENST00000375599 RAPGEF3O95398 923 aa43.37■■■■■ 4.53
RSG1-201ENST00000375599 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.26■■■■■ 4.52
RSG1-201ENST00000375599 ABCC1P33527 1531 aa43.26■■■■■ 4.52
RSG1-201ENST00000375599 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.25■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.24■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 RICTORQ6R327 1708 aa43.23■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.22■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.2■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.51
RSG1-201ENST00000375599 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 MIA2Q96PC5 1412 aa43.19■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.18■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.18■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.15■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 AFAP1Q8N556 730 aa43.15■■■■■ 4.5
RSG1-201ENST00000375599 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.12■■■■■ 4.49
RSG1-201ENST00000375599 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.11■■■■■ 4.49
RSG1-201ENST00000375599 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.1■■■■■ 4.49
RSG1-201ENST00000375599 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.06■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 KDM5CP41229 1560 aa43.05■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.04■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.03■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 MBD5Q9P267 1494 aa43.02■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.01■■■■■ 4.48
RSG1-201ENST00000375599 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.97■■■■■ 4.47
RSG1-201ENST00000375599 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.97■■■■■ 4.47
RSG1-201ENST00000375599 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
RSG1-201ENST00000375599 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.95■■■■■ 4.47
RSG1-201ENST00000375599 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.95■■■■■ 4.47
RSG1-201ENST00000375599 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.93■■■■■ 4.46
RSG1-201ENST00000375599 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.92■■■■■ 4.46
RSG1-201ENST00000375599 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.92■■■■■ 4.46
RSG1-201ENST00000375599 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.9■■■■■ 4.46
RSG1-201ENST00000375599 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
RSG1-201ENST00000375599 TSPY4P0CV99 314 aa42.85■■■■■ 4.45
RSG1-201ENST00000375599 TSPY10P0CW01 314 aa42.85■■■■■ 4.45
RSG1-201ENST00000375599 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
RSG1-201ENST00000375599 ATP10AO60312 1499 aa42.81■■■■■ 4.44
RSG1-201ENST00000375599 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.81■■■■■ 4.44
RSG1-201ENST00000375599 ATP7AQ04656 1500 aa42.8■■■■■ 4.44
RSG1-201ENST00000375599 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.78■■■■■ 4.44
RSG1-201ENST00000375599 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
RSG1-201ENST00000375599 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.75■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.75■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 ABCA6Q8N139 1617 aa42.74■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 ABCC5O15440 1437 aa42.71■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 DAPK1P53355 1430 aa42.7■■■■■ 4.43
RSG1-201ENST00000375599 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.65■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 REREQ9P2R6 1566 aa42.64■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.63■■■■■ 4.42
RSG1-201ENST00000375599 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.61■■■■■ 4.41
RSG1-201ENST00000375599 A2MP01023 1474 aa42.58■■■■■ 4.41
RSG1-201ENST00000375599 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.57■■■■■ 4.41
RSG1-201ENST00000375599 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.55■■■■■ 4.4
RSG1-201ENST00000375599 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.53■■■■■ 4.4
RSG1-201ENST00000375599 AGLP35573 1532 aa42.51■■■■■ 4.4
RSG1-201ENST00000375599 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.5■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 PLXNC1O60486 1568 aa42.49■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.48■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 ITGAEP38570 1179 aa42.47■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 MLECQ14165 292 aa42.47■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.47■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.45■■■■■ 4.39
RSG1-201ENST00000375599 KIF15Q9NS87 1388 aa42.42■■■■■ 4.38
RSG1-201ENST00000375599 PTPRKQ15262 1439 aa42.41■■■■■ 4.38
RSG1-201ENST00000375599 ADGRL2O95490 1459 aa42.4■■■■■ 4.38
RSG1-201ENST00000375599 NCOA1Q15788 1441 aa42.4■■■■■ 4.38
RSG1-201ENST00000375599 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.37■■■■■ 4.37
RSG1-201ENST00000375599 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.37■■■■■ 4.37
RSG1-201ENST00000375599 KIF3BO15066 747 aa42.34■■■■■ 4.37
RSG1-201ENST00000375599 ROCK1Q13464 1354 aa42.31■■■■■ 4.36
RSG1-201ENST00000375599 GGT6Q6P531 493 aa42.29■■■■■ 4.36
RSG1-201ENST00000375599 MADDQ8WXG6 1647 aa42.27■■■■■ 4.36
RSG1-201ENST00000375599 ERBINQ96RT1 1412 aa42.26■■■■■ 4.36
RSG1-201ENST00000375599 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
RSG1-201ENST00000375599 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
RSG1-201ENST00000375599 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.21■■■■■ 4.35
RSG1-201ENST00000375599 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.2■■■■■ 4.35
RSG1-201ENST00000375599 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
RSG1-201ENST00000375599 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms