RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 PLCH2O75038 1416 aa27.08■■□□□ 1.93
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C9orf116-201ENST00000371786 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.03■■□□□ 1.92
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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C9orf116-201ENST00000371786 DIP2BQ9P265 1576 aa27.01■■□□□ 1.92
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C9orf116-201ENST00000371786 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.91■■□□□ 1.9
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C9orf116-201ENST00000371786 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
C9orf116-201ENST00000371786 AKNAQ7Z591 1439 aa26.83■■□□□ 1.89
C9orf116-201ENST00000371786 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.83■■□□□ 1.89
C9orf116-201ENST00000371786 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.83■■□□□ 1.89
C9orf116-201ENST00000371786 NEO1Q92859 1461 aa26.81■■□□□ 1.88
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C9orf116-201ENST00000371786 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf116-201ENST00000371786 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.76■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.75■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.75■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 TSPY4P0CV99 314 aa26.75■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 TSPY10P0CW01 314 aa26.75■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 ROCK1Q13464 1354 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf116-201ENST00000371786 ADGRL2O95490 1459 aa26.7■■□□□ 1.87
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C9orf116-201ENST00000371786 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.69■■□□□ 1.86
C9orf116-201ENST00000371786 HFM1A2PYH4 1435 aa26.68■■□□□ 1.86
C9orf116-201ENST00000371786 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.68■■□□□ 1.86
C9orf116-201ENST00000371786 AFAP1Q8N556 730 aa26.68■■□□□ 1.86
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C9orf116-201ENST00000371786 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.64■■□□□ 1.86
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C9orf116-201ENST00000371786 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.53■■□□□ 1.84
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C9orf116-201ENST00000371786 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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C9orf116-201ENST00000371786 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.47■■□□□ 1.83
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C9orf116-201ENST00000371786 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.37■■□□□ 1.81
C9orf116-201ENST00000371786 A2MP01023 1474 aa26.36■■□□□ 1.81
C9orf116-201ENST00000371786 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
C9orf116-201ENST00000371786 TRIM52Q96A61 297 aa26.35■■□□□ 1.81
C9orf116-201ENST00000371786 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
C9orf116-201ENST00000371786 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
C9orf116-201ENST00000371786 ATP10AO60312 1499 aa26.3■■□□□ 1.8
C9orf116-201ENST00000371786 UNC13BO14795 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
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C9orf116-201ENST00000371786 KIF3BO15066 747 aa26.26■■□□□ 1.79
C9orf116-201ENST00000371786 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.25■■□□□ 1.79
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