RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.71■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FANCAO15360 1455 aa33.71■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.7■■■□□ 2.99
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MIA2Q96PC5 1412 aa33.69■■■□□ 2.98
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.67■■■□□ 2.98
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NEO1Q92859 1461 aa33.65■■■□□ 2.98
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.64■■■□□ 2.98
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AKNAQ7Z591 1439 aa33.62■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.62■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.58■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.57■■■□□ 2.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADGRL1O94910 1474 aa33.55■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCC1P33527 1531 aa33.54■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.53■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.51■■■□□ 2.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.51■■■□□ 2.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.5■■■□□ 2.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.48■■■□□ 2.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.951e-9■■■□□ 17.9
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.942e-6■■□□□ 11.7
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.42■■■□□ 2.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.39■■■□□ 2.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.39■■■□□ 2.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAPGEF3O95398 923 aa33.38■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.36■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AFAP1Q8N556 730 aa33.36■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KDM6BO15054 1643 aa33.36■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RICTORQ6R327 1708 aa33.35■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.35■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.35■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.34■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCC5O15440 1437 aa33.33■■■□□ 2.93
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DAPK1P53355 1430 aa33.32■■■□□ 2.92
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KDM5CP41229 1560 aa33.3■■■□□ 2.92
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ITGAEP38570 1179 aa33.27■■■□□ 2.92
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TSPY4P0CV99 314 aa33.26■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TSPY10P0CW01 314 aa33.26■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.26■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PTPRKQ15262 1439 aa33.24■■■□□ 2.91
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.23■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.23■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.21■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.2■■■□□ 2.91
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.2■■■□□ 2.91
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.19■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.18■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.18■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.17■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATP7AQ04656 1500 aa33.16■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.16■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.16■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.15■■■□□ 2.9
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.1■■■□□ 2.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADGRL2O95490 1459 aa33.1■■■□□ 2.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.09■■■□□ 2.89
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NCOA1Q15788 1441 aa33.07■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.07■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLXNC1O60486 1568 aa33.06■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ROCK1Q13464 1354 aa33.06■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ABCA6Q8N139 1617 aa33.06■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.04■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.03■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.02■■■□□ 2.88
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF15Q9NS87 1388 aa33■■■□□ 2.87
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATP10AO60312 1499 aa32.99■■■□□ 2.87
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HFM1A2PYH4 1435 aa32.92■■■□□ 2.86
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NAIPQ13075 1403 aa32.91■■■□□ 2.86
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 REREQ9P2R6 1566 aa32.91■■■□□ 2.86
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.88■■■□□ 2.85
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.87■■■□□ 2.85
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.86■■■□□ 2.85
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERBINQ96RT1 1412 aa32.85■■■□□ 2.85
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.84■■■□□ 2.85
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.81■■■□□ 2.84
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AGLP35573 1532 aa32.8■■■□□ 2.84
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF3BO15066 747 aa32.76■■■□□ 2.83
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.75■■■□□ 2.83
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.71■■■□□ 2.83
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DEPDC5O75140 1603 aa32.66■■■□□ 2.82
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