RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.57■■■■■ 4.88
ECHS1-201ENST00000368547 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.57■■■■■ 4.88
ECHS1-201ENST00000368547 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
ECHS1-201ENST00000368547 FANCAO15360 1455 aa45.49■■■■■ 4.87
ECHS1-201ENST00000368547 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.45■■■■■ 4.87
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.45■■■■■ 4.87
ECHS1-201ENST00000368547 MIA2Q96PC5 1412 aa45.44■■■■■ 4.87
ECHS1-201ENST00000368547 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.44■■■■■ 4.86
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.43■■■■■ 4.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
ECHS1-201ENST00000368547 NEO1Q92859 1461 aa45.38■■■■■ 4.86
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.38■■■■■ 4.85
ECHS1-201ENST00000368547 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.36■■■■■ 4.85
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
ECHS1-201ENST00000368547 AKNAQ7Z591 1439 aa45.34■■■■■ 4.85
ECHS1-201ENST00000368547 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.32■■■■■ 4.85
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRL1O94910 1474 aa45.26■■■■■ 4.84
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC1P33527 1531 aa45.26■■■■■ 4.84
ECHS1-201ENST00000368547 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
ECHS1-201ENST00000368547 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.22■■■■■ 4.83
ECHS1-201ENST00000368547 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.21■■■■■ 4.83
ECHS1-201ENST00000368547 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
ECHS1-201ENST00000368547 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.19■■■■■ 4.82
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.18■■■■■ 4.82
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.18■■■■■ 4.82
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
ECHS1-201ENST00000368547 MBD5Q9P267 1494 aa45.11■■■■■ 4.81
ECHS1-201ENST00000368547 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.09■■■■■ 4.813e-8■■■■■ 27.7
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ECHS1-201ENST00000368547 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.06■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.06■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 RICTORQ6R327 1708 aa45.04■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.03■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 KDM6BO15054 1643 aa45.03■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEF3O95398 923 aa45.02■■■■■ 4.8
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC141Q6ZP82 1450 aa45■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 AFAP1Q8N556 730 aa45■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.99■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.97■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 DAPK1P53355 1430 aa44.96■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC5O15440 1437 aa44.95■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.94■■■■■ 4.79
ECHS1-201ENST00000368547 KDM5CP41229 1560 aa44.93■■■■■ 4.78
ECHS1-201ENST00000368547 ITGAEP38570 1179 aa44.91■■■■■ 4.78
ECHS1-201ENST00000368547 TSPY4P0CV99 314 aa44.86■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 TSPY10P0CW01 314 aa44.86■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.83■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRKQ15262 1439 aa44.82■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.82■■■■■ 4.77
ECHS1-201ENST00000368547 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.81■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.81■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.8■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.77■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.77■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.77■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 ATP7AQ04656 1500 aa44.76■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.76■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.76■■■■■ 4.76
ECHS1-201ENST00000368547 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.75■■■■■ 4.75
ECHS1-201ENST00000368547 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.73■■■■■ 4.75
ECHS1-201ENST00000368547 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.73■■■■■ 4.75
ECHS1-201ENST00000368547 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.7■■■■■ 4.75
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRL2O95490 1459 aa44.65■■■■■ 4.74
ECHS1-201ENST00000368547 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.65■■■■■ 4.74
ECHS1-201ENST00000368547 PLXNC1O60486 1568 aa44.63■■■■■ 4.74
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA6Q8N139 1617 aa44.63■■■■■ 4.74
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.62■■■■■ 4.73
ECHS1-201ENST00000368547 NCOA1Q15788 1441 aa44.61■■■■■ 4.73
ECHS1-201ENST00000368547 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.59■■■■■ 4.73
ECHS1-201ENST00000368547 ROCK1Q13464 1354 aa44.59■■■■■ 4.73
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.59■■■■■ 4.73
ECHS1-201ENST00000368547 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.57■■■■■ 4.72
ECHS1-201ENST00000368547 KIF15Q9NS87 1388 aa44.53■■■■■ 4.72
ECHS1-201ENST00000368547 ATP10AO60312 1499 aa44.48■■■■■ 4.71
ECHS1-201ENST00000368547 A2MP01023 1474 aa44.44■■■■■ 4.71
ECHS1-201ENST00000368547 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.44■■■■■ 4.71
ECHS1-201ENST00000368547 HFM1A2PYH4 1435 aa44.42■■■■■ 4.7
ECHS1-201ENST00000368547 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.42■■■■■ 4.7
ECHS1-201ENST00000368547 NAIPQ13075 1403 aa44.41■■■■■ 4.7
ECHS1-201ENST00000368547 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
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ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.34■■■■■ 4.69
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.34■■■■■ 4.69
ECHS1-201ENST00000368547 ERBINQ96RT1 1412 aa44.32■■■■■ 4.69
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
ECHS1-201ENST00000368547 SETD5Q9C0A6 1442 aa44.26■■■■■ 4.68
ECHS1-201ENST00000368547 AGLP35573 1532 aa44.23■■■■■ 4.67
ECHS1-201ENST00000368547 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.21■■■■■ 4.67
ECHS1-201ENST00000368547 KIF3BO15066 747 aa44.2■■■■■ 4.67
ECHS1-201ENST00000368547 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
ECHS1-201ENST00000368547 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa44.16■■■■■ 4.66
ECHS1-201ENST00000368547 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
ECHS1-201ENST00000368547 DEPDC5O75140 1603 aa44.09■■■■■ 4.65
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