RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.79■□□□□ 0.12
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PTPRC-202ENST00000367364 C2orf72A6NCS6 295 aa15.5■□□□□ 0.07
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.38■□□□□ 0.05
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PTPRC-202ENST00000367364 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP33O14559 1287 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTPRC-202ENST00000367364 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.02■□□□□ -0
PTPRC-202ENST00000367364 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15□□□□□ -0.01
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PTPRC-202ENST00000367364 KCNK17Q96T54 332 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRC-202ENST00000367364 OXER1Q8TDS5 423 aa14.91□□□□□ -0.02
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PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.84□□□□□ -0.03
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PTPRC-202ENST00000367364 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRC-202ENST00000367364 FOSBP53539 338 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRC-202ENST00000367364 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.77□□□□□ -0.05
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PTPRC-202ENST00000367364 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.71□□□□□ -0.05
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PTPRC-202ENST00000367364 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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PTPRC-202ENST00000367364 PDE4AP27815 886 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRC-202ENST00000367364 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRC-202ENST00000367364 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-202ENST00000367364 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.41□□□□□ -0.1
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