RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.77■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 TIAM1Q13009 1591 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.76■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.73■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.72■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC1P33527 1531 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.64■■□□□ 1.38
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K1Q13233 1512 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 NCOA2Q15596 1464 aa23.62■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.62■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 KDM5CP41229 1560 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 AFAP1Q8N556 730 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.6■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAG1-201ENST00000361211 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.56■■□□□ 1.36
CSAG1-201ENST00000361211 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.55■■□□□ 1.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.51■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.51■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.5■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.5■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 ATP10AO60312 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA6Q8N139 1617 aa23.49■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 APLP2Q06481 763 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.47■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.47■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.46■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 MBD5Q9P267 1494 aa23.46■■□□□ 1.35
CSAG1-201ENST00000361211 MADDQ8WXG6 1647 aa23.43■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.42■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 REREQ9P2R6 1566 aa23.4■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 ATP7AQ04656 1500 aa23.4■■□□□ 1.34
CSAG1-201ENST00000361211 MLECQ14165 292 aa23.38■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.36■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 MIA2Q96PC5 1412 aa23.36■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRMP28827 1452 aa23.36■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.34■■□□□ 1.33
CSAG1-201ENST00000361211 AGLP35573 1532 aa23.33■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.3■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.29■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 PLXNC1O60486 1568 aa23.29■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.28■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.28■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 A2MP01023 1474 aa23.28■■□□□ 1.32
CSAG1-201ENST00000361211 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.26■■□□□ 1.31
CSAG1-201ENST00000361211 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.25■■□□□ 1.31
CSAG1-201ENST00000361211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CSAG1-201ENST00000361211 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.22■■□□□ 1.31
CSAG1-201ENST00000361211 TSPY4P0CV99 314 aa23.2■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 TSPY10P0CW01 314 aa23.2■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.2■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC5O15440 1437 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.17■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 DAPK1P53355 1430 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG1-201ENST00000361211 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.14■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 GGT6Q6P531 493 aa23.11■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 C3P01024 1663 aa23.1■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.08■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 KIF3BO15066 747 aa23.08■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CSAG1-201ENST00000361211 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.07■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 MROH2AA6NES4 1674 aa23.06■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 KIF15Q9NS87 1388 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYM3Q14202 1370 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms