RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 RAPGEF3O95398 923 aa22.99■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.98■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.98■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.97■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 MAP3K1Q13233 1512 aa22.96■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
BRMS1-201ENST00000359957 RICTORQ6R327 1708 aa22.95■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.94■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.93■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.91■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.91■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.89■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.88■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 NCOA2Q15596 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 ABCC1P33527 1531 aa22.87■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.85■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.84■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.83■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.83■■□□□ 1.25
BRMS1-201ENST00000359957 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 KDM5CP41229 1560 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 AFAP1Q8N556 730 aa22.79■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.78■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.78■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.76■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.75■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.73■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 ATP10AO60312 1499 aa22.71■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.7■■□□□ 1.23
BRMS1-201ENST00000359957 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.7■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.7■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 MIA2Q96PC5 1412 aa22.68■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.66■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.65■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.65■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 ABCA6Q8N139 1617 aa22.65■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.64■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 ATP7AQ04656 1500 aa22.64■■□□□ 1.22
BRMS1-201ENST00000359957 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.64■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 MBD5Q9P267 1494 aa22.63■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 REREQ9P2R6 1566 aa22.62■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.61■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 TSPY4P0CV99 314 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 TSPY10P0CW01 314 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.59■■□□□ 1.21
BRMS1-201ENST00000359957 MLECQ14165 292 aa22.57■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.57■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.57■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.56■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 MADDQ8WXG6 1647 aa22.56■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.55■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 AGLP35573 1532 aa22.53■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 A2MP01023 1474 aa22.52■■□□□ 1.2
BRMS1-201ENST00000359957 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.51■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 PTPRMP28827 1452 aa22.49■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.48■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 PLXNC1O60486 1568 aa22.47■■□□□ 1.19
BRMS1-201ENST00000359957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.45■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.44■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 DAPK1P53355 1430 aa22.42■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 ABCC5O15440 1437 aa22.41■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.4■■□□□ 1.18
BRMS1-201ENST00000359957 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.38■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 GGT6Q6P531 493 aa22.38■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 KIF3BO15066 747 aa22.36■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 KIF15Q9NS87 1388 aa22.33■■□□□ 1.17
BRMS1-201ENST00000359957 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.31■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 MROH2AA6NES4 1674 aa22.31■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.31■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 C3P01024 1663 aa22.29■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.28■■□□□ 1.16
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