RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356489.9

BCKDHB-202, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-202ENST00000356489 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.75■■■■□ 3.47
BCKDHB-202ENST00000356489 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
BCKDHB-202ENST00000356489 FANCAO15360 1455 aa36.73■■■■□ 3.47
BCKDHB-202ENST00000356489 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.7■■■■□ 3.47
BCKDHB-202ENST00000356489 NEO1Q92859 1461 aa36.69■■■■□ 3.46
BCKDHB-202ENST00000356489 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.67■■■■□ 3.46
BCKDHB-202ENST00000356489 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.64■■■■□ 3.46
BCKDHB-202ENST00000356489 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.61■■■■□ 3.45
BCKDHB-202ENST00000356489 AKNAQ7Z591 1439 aa36.61■■■■□ 3.45
BCKDHB-202ENST00000356489 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
BCKDHB-202ENST00000356489 MIA2Q96PC5 1412 aa36.57■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCC1P33527 1531 aa36.57■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 ADGRL1O94910 1474 aa36.55■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.54■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 KDM6BO15054 1643 aa36.53■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.51■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.51■■■■□ 3.44
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 RICTORQ6R327 1708 aa36.5■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.48■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.48■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.46■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.46■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.46■■■■□ 3.43
BCKDHB-202ENST00000356489 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
BCKDHB-202ENST00000356489 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.43■■■■□ 3.42
BCKDHB-202ENST00000356489 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
BCKDHB-202ENST00000356489 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.4■■■■□ 3.42
BCKDHB-202ENST00000356489 MBD5Q9P267 1494 aa36.38■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.36■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.35■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 KDM5CP41229 1560 aa36.35■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.34■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 RAPGEF3O95398 923 aa36.34■■■■□ 3.41
BCKDHB-202ENST00000356489 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.411e-9■■■■■ 32.5
BCKDHB-202ENST00000356489 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.31■■■■□ 3.4
BCKDHB-202ENST00000356489 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
BCKDHB-202ENST00000356489 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.28■■■■□ 3.4
BCKDHB-202ENST00000356489 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.27■■■■□ 3.4
BCKDHB-202ENST00000356489 AFAP1Q8N556 730 aa36.26■■■■□ 3.4
BCKDHB-202ENST00000356489 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.23■■■■□ 3.39
BCKDHB-202ENST00000356489 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.39
BCKDHB-202ENST00000356489 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
BCKDHB-202ENST00000356489 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
BCKDHB-202ENST00000356489 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.2■■■■□ 3.39
BCKDHB-202ENST00000356489 DAPK1P53355 1430 aa36.18■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.18■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCC5O15440 1437 aa36.18■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.17■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.17■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.16■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.15■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 ATP7AQ04656 1500 aa36.14■■■■□ 3.38
BCKDHB-202ENST00000356489 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.13■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.12■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCA6Q8N139 1617 aa36.11■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
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BCKDHB-202ENST00000356489 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.08■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.08■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.07■■■■□ 3.37
BCKDHB-202ENST00000356489 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.07■■■■□ 3.36
BCKDHB-202ENST00000356489 PTPRKQ15262 1439 aa36.05■■■■□ 3.36
BCKDHB-202ENST00000356489 TSPY4P0CV99 314 aa36.03■■■■□ 3.36
BCKDHB-202ENST00000356489 TSPY10P0CW01 314 aa36.03■■■■□ 3.36
BCKDHB-202ENST00000356489 PLXNC1O60486 1568 aa36.03■■■■□ 3.36
BCKDHB-202ENST00000356489 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.98■■■■□ 3.35
BCKDHB-202ENST00000356489 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.97■■■■□ 3.35
BCKDHB-202ENST00000356489 ADGRL2O95490 1459 aa35.97■■■■□ 3.35
BCKDHB-202ENST00000356489 ITGAEP38570 1179 aa35.94■■■■□ 3.34
BCKDHB-202ENST00000356489 ATP10AO60312 1499 aa35.94■■■■□ 3.34
BCKDHB-202ENST00000356489 REREQ9P2R6 1566 aa35.94■■■■□ 3.34
BCKDHB-202ENST00000356489 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.93■■■■□ 3.34
BCKDHB-202ENST00000356489 NCOA1Q15788 1441 aa35.9■■■■□ 3.34
BCKDHB-202ENST00000356489 ROCK1Q13464 1354 aa35.86■■■■□ 3.33
BCKDHB-202ENST00000356489 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.86■■■■□ 3.33
BCKDHB-202ENST00000356489 A2MP01023 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
BCKDHB-202ENST00000356489 KIF15Q9NS87 1388 aa35.83■■■■□ 3.33
BCKDHB-202ENST00000356489 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.82■■■■□ 3.33
BCKDHB-202ENST00000356489 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.79■■■■□ 3.32
BCKDHB-202ENST00000356489 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
BCKDHB-202ENST00000356489 AGLP35573 1532 aa35.78■■■■□ 3.32
BCKDHB-202ENST00000356489 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.78■■■■□ 3.32
BCKDHB-202ENST00000356489 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.78■■■■□ 3.32
BCKDHB-202ENST00000356489 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
BCKDHB-202ENST00000356489 ERBINQ96RT1 1412 aa35.72■■■■□ 3.31
BCKDHB-202ENST00000356489 HFM1A2PYH4 1435 aa35.69■■■■□ 3.3
BCKDHB-202ENST00000356489 NAIPQ13075 1403 aa35.68■■■■□ 3.3
BCKDHB-202ENST00000356489 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
BCKDHB-202ENST00000356489 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.66■■■■□ 3.3
BCKDHB-202ENST00000356489 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
BCKDHB-202ENST00000356489 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
BCKDHB-202ENST00000356489 DEPDC5O75140 1603 aa35.62■■■■□ 3.29
BCKDHB-202ENST00000356489 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.6■■■■□ 3.29
BCKDHB-202ENST00000356489 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.58■■■■□ 3.29
BCKDHB-202ENST00000356489 KIF3BO15066 747 aa35.57■■■■□ 3.29
BCKDHB-202ENST00000356489 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.54■■■■□ 3.28
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