RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 PTPRMP28827 1452 aa26.04■■□□□ 1.76
SYCE1-202ENST00000343131 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.04■■□□□ 1.76
SYCE1-202ENST00000343131 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.01■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 PREX2Q70Z35 1606 aa26■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP5Q13017 1502 aa26■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.99■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 CLIP1P30622 1438 aa25.99■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.99■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.99■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.96■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.96■■□□□ 1.75
SYCE1-202ENST00000343131 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.95■■□□□ 1.74
SYCE1-202ENST00000343131 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.94■■□□□ 1.74
SYCE1-202ENST00000343131 KDM5CP41229 1560 aa25.92■■□□□ 1.74
SYCE1-202ENST00000343131 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.9■■□□□ 1.74
SYCE1-202ENST00000343131 ABCC1P33527 1531 aa25.88■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.88■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.87■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 ABCA6Q8N139 1617 aa25.85■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.85■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.84■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
SYCE1-202ENST00000343131 ATP10AO60312 1499 aa25.82■■□□□ 1.72
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.8■■□□□ 1.72
SYCE1-202ENST00000343131 MLECQ14165 292 aa25.78■■□□□ 1.72
SYCE1-202ENST00000343131 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.78■■□□□ 1.72
SYCE1-202ENST00000343131 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.75■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.75■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 AFAP1Q8N556 730 aa25.75■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.74■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 REREQ9P2R6 1566 aa25.74■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.73■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.71■■□□□ 1.71
SYCE1-202ENST00000343131 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.69■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 CEP162Q5TB80 1403 aa25.69■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.67■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.65■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 TIAM1Q13009 1591 aa25.65■■□□□ 1.7
SYCE1-202ENST00000343131 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 C3P01024 1663 aa25.63■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.61■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 AGLP35573 1532 aa25.61■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 HSPA2P54652 639 aa25.6■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 ATP7AQ04656 1500 aa25.58■■□□□ 1.69
SYCE1-202ENST00000343131 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.57■■□□□ 1.68
SYCE1-202ENST00000343131 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
SYCE1-202ENST00000343131 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SYCE1-202ENST00000343131 PLXNC1O60486 1568 aa25.52■■□□□ 1.68
SYCE1-202ENST00000343131 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.5■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 MROH2AA6NES4 1674 aa25.49■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.49■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 STRCQ7RTU9 1775 aa25.46■■□□□ 1.67
SYCE1-202ENST00000343131 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.45■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 NCOA2Q15596 1464 aa25.44■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 A2MP01023 1474 aa25.41■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 MBD5Q9P267 1494 aa25.4■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.4■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.4■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.39■■□□□ 1.66
SYCE1-202ENST00000343131 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SYCE1-202ENST00000343131 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.37■■□□□ 1.65
SYCE1-202ENST00000343131 FBXO41Q8TF61 875 aa25.35■■□□□ 1.65
SYCE1-202ENST00000343131 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.34■■□□□ 1.65
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.34■■□□□ 1.65
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.32■■□□□ 1.64
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.29■■□□□ 1.64
SYCE1-202ENST00000343131 NPATQ14207 1427 aa25.28■■□□□ 1.64
SYCE1-202ENST00000343131 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.27■■□□□ 1.64
SYCE1-202ENST00000343131 ZMYM3Q14202 1370 aa25.25■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.24■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 GGT6Q6P531 493 aa25.22■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 MAP3K1Q13233 1512 aa25.22■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 NCOA1Q15788 1441 aa25.21■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 PTPRKQ15262 1439 aa25.2■■□□□ 1.63
SYCE1-202ENST00000343131 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.18■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.18■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 CERKQ8TCT0 537 aa25.17■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 PTPRTO14522 1441 aa25.16■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.16■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.14■■□□□ 1.62
SYCE1-202ENST00000343131 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SYCE1-202ENST00000343131 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.13■■□□□ 1.61
SYCE1-202ENST00000343131 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.12■■□□□ 1.61
SYCE1-202ENST00000343131 KIF3BO15066 747 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms