RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 PREX2Q70Z35 1606 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 MADDQ8WXG6 1647 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6-201ENST00000329970 PTPRMP28827 1452 aa22.08■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 KDM5CP41229 1560 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6-201ENST00000329970 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC1P33527 1531 aa22.01■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP10AO60312 1499 aa21.99■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.98■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 REREQ9P2R6 1566 aa21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.97■■□□□ 1.11
GTF3C6-201ENST00000329970 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.95■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP162Q5TB80 1403 aa21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCA6Q8N139 1617 aa21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 AFAP1Q8N556 730 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6-201ENST00000329970 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 AGLP35573 1532 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TIAM1Q13009 1591 aa21.82■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MLECQ14165 292 aa21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP7AQ04656 1500 aa21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 PLXNC1O60486 1568 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 C3P01024 1663 aa21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6-201ENST00000329970 MROH2AA6NES4 1674 aa21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 NCOA2Q15596 1464 aa21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 MBD5Q9P267 1494 aa21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 MAP3K1Q13233 1512 aa21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.65■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 A2MP01023 1474 aa21.64■■□□□ 1.06
GTF3C6-201ENST00000329970 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.63■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.62■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.61■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 HSPA2P54652 639 aa21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6-201ENST00000329970 STRCQ7RTU9 1775 aa21.57■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 NPATQ14207 1427 aa21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.55■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.53■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GTF3C6-201ENST00000329970 ZMYM3Q14202 1370 aa21.51■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 MIA2Q96PC5 1412 aa21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 FBXO41Q8TF61 875 aa21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6-201ENST00000329970 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 PTPRKQ15262 1439 aa21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 PTPRTO14522 1441 aa21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 TSPY4P0CV99 314 aa21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 TSPY10P0CW01 314 aa21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6-201ENST00000329970 NCOA1Q15788 1441 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms