RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326407.10

ITM2C-201, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-201ENST00000326407 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.16■■□□□ 1.46
ITM2C-201ENST00000326407 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.15■■□□□ 1.46
ITM2C-201ENST00000326407 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.15■■□□□ 1.46
ITM2C-201ENST00000326407 DIP2BQ9P265 1576 aa24.12■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 KIF14Q15058 1648 aa24.1■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 GLI2P10070 1586 aa24.1■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.09■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.09■■□□□ 1.45
ITM2C-201ENST00000326407 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
ITM2C-201ENST00000326407 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.06■■□□□ 1.44
ITM2C-201ENST00000326407 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ITM2C-201ENST00000326407 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.04■■□□□ 1.44
ITM2C-201ENST00000326407 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.02■■□□□ 1.44
ITM2C-201ENST00000326407 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.99■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 CD109Q6YHK3 1445 aa23.99■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 HFM1A2PYH4 1435 aa23.97■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 PTPRKQ15262 1439 aa23.97■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 PLCH2O75038 1416 aa23.95■■□□□ 1.43
ITM2C-201ENST00000326407 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.95■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.92■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.92■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.92■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 MIA2Q96PC5 1412 aa23.91■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.91■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.9■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 PREX2Q70Z35 1606 aa23.9■■□□□ 1.42
ITM2C-201ENST00000326407 NAIPQ13075 1403 aa23.88■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.87■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.87■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.86■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.86■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 TSPOAP1O95153 1857 aa23.85■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 FANCAO15360 1455 aa23.85■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.85■■□□□ 1.41
ITM2C-201ENST00000326407 NEO1Q92859 1461 aa23.82■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.81■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.79■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 AKNAQ7Z591 1439 aa23.78■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.76■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 TONSLQ96HA7 1378 aa23.74■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.73■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 DAPK1P53355 1430 aa23.73■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.73■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 ADGRL1O94910 1474 aa23.72■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 ABCC1P33527 1531 aa23.71■■□□□ 1.39
ITM2C-201ENST00000326407 KDM6BO15054 1643 aa23.7■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.7■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.69■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 MBD5Q9P267 1494 aa23.67■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.67■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 TRIM52Q96A61 297 aa23.66■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 ABCC5O15440 1437 aa23.66■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 ROCK1Q13464 1354 aa23.65■■□□□ 1.38
ITM2C-201ENST00000326407 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.63■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.63■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.63■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.62■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.62■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 RAPGEF3O95398 923 aa23.61■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.6■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.6■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 AFAP1Q8N556 730 aa23.6■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
ITM2C-201ENST00000326407 RICTORQ6R327 1708 aa23.58■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.57■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 KDM5CP41229 1560 aa23.55■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 TSPY4P0CV99 314 aa23.53■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 TSPY10P0CW01 314 aa23.53■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.52■■□□□ 1.36
ITM2C-201ENST00000326407 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.51■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.51■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.48■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.48■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.48■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 ADGRL2O95490 1459 aa23.47■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.46■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.46■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ITM2C-201ENST00000326407 NCOA1Q15788 1441 aa23.45■■□□□ 1.34
ITM2C-201ENST00000326407 ATP7AQ04656 1500 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 307.3 ms