RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.3■■■□□ 2.6
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PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.25■■■□□ 2.59
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PTPRCAP-201ENST00000326294 TIAM1Q13009 1591 aa31.19■■■□□ 2.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM5CP41229 1560 aa31.14■■■□□ 2.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.14■■■□□ 2.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.12■■■□□ 2.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K1Q13233 1512 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.05■■■□□ 2.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.04■■■□□ 2.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NCOA2Q15596 1464 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFAP1Q8N556 730 aa31.03■■■□□ 2.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
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PTPRCAP-201ENST00000326294 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP10AO60312 1499 aa30.97■■■□□ 2.55
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.96■■■□□ 2.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.95■■■□□ 2.54
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.93■■■□□ 2.54
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PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.88■■■□□ 2.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRMP28827 1452 aa30.85■■■□□ 2.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP7AQ04656 1500 aa30.83■■■□□ 2.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.66■■■□□ 2.5
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.58■■■□□ 2.49
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.52■■■□□ 2.48
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PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPY10P0CW01 314 aa30.47■■■□□ 2.47
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC5O15440 1437 aa30.43■■■□□ 2.46
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT6Q6P531 493 aa30.37■■■□□ 2.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF3BO15066 747 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYM3Q14202 1370 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.29■■■□□ 2.44
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