RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLCH2O75038 1416 aa26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF20-201ENST00000316412 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 GLI2P10070 1586 aa26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 DIP2BQ9P265 1576 aa26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITGAEP38570 1179 aa26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTPRKQ15262 1439 aa26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 CD109Q6YHK3 1445 aa26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF20-201ENST00000316412 DAPK1P53355 1430 aa26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC5O15440 1437 aa26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 FANCAO15360 1455 aa26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 MBD5Q9P267 1494 aa26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC1P33527 1531 aa26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.15■■□□□ 1.78
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PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF20-201ENST00000316412 AKNAQ7Z591 1439 aa26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF20-201ENST00000316412 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEO1Q92859 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRL1O94910 1474 aa26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 ROCK1Q13464 1354 aa26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRL2O95490 1459 aa26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 HFM1A2PYH4 1435 aa26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF20-201ENST00000316412 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF20-201ENST00000316412 NAIPQ13075 1403 aa26■■□□□ 1.75
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCOA1Q15788 1441 aa25.99■■□□□ 1.75
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PRAMEF20-201ENST00000316412 TSPY10P0CW01 314 aa25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF20-201ENST00000316412 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.98■■□□□ 1.75
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PRAMEF20-201ENST00000316412 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF20-201ENST00000316412 AFAP1Q8N556 730 aa25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLXNC1O60486 1568 aa25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 RICTORQ6R327 1708 aa25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM5CP41229 1560 aa25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM6BO15054 1643 aa25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 HRCP23327 699 aa25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP7AQ04656 1500 aa25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF20-201ENST00000316412 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF15Q9NS87 1388 aa25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF20-201ENST00000316412 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAPGEF3O95398 923 aa25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF20-201ENST00000316412 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCA6Q8N139 1617 aa25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERBINQ96RT1 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 UNC13BO14795 1591 aa25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 A2MP01023 1474 aa25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM52Q96A61 297 aa25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF20-201ENST00000316412 DEPDC5O75140 1603 aa25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF20-201ENST00000316412 PZPP20742 1482 aa25.6■■□□□ 1.69
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