RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.61■■■□□ 2.97
STX4-201ENST00000313843 TSPOAP1O95153 1857 aa33.6■■■□□ 2.97
STX4-201ENST00000313843 MIA2Q96PC5 1412 aa33.6■■■□□ 2.97
STX4-201ENST00000313843 PLCH2O75038 1416 aa33.58■■■□□ 2.97
STX4-201ENST00000313843 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.58■■■□□ 2.97
STX4-201ENST00000313843 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.55■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.53■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
STX4-201ENST00000313843 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.49■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.48■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.47■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 FANCAO15360 1455 aa33.47■■■□□ 2.95
STX4-201ENST00000313843 ABCC1P33527 1531 aa33.42■■■□□ 2.94
STX4-201ENST00000313843 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.943e-8■□□□□ 8.2
STX4-201ENST00000313843 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.4■■■□□ 2.94
STX4-201ENST00000313843 NEO1Q92859 1461 aa33.4■■■□□ 2.94
STX4-201ENST00000313843 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
STX4-201ENST00000313843 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.39■■■□□ 2.94
STX4-201ENST00000313843 AKNAQ7Z591 1439 aa33.36■■■□□ 2.93
STX4-201ENST00000313843 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.35■■■□□ 2.93
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.33■■■□□ 2.93
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.33■■■□□ 2.93
STX4-201ENST00000313843 ADGRL1O94910 1474 aa33.32■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 ITGAEP38570 1179 aa33.3■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.3■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 MBD5Q9P267 1494 aa33.3■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 DAPK1P53355 1430 aa33.29■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.29■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.27■■■□□ 2.92
STX4-201ENST00000313843 ABCC5O15440 1437 aa33.26■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.25■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.24■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 PTPRKQ15262 1439 aa33.24■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.23■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.2■■■□□ 2.91
STX4-201ENST00000313843 RICTORQ6R327 1708 aa33.2■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.17■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.15■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.14■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.14■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.14■■■□□ 2.9
STX4-201ENST00000313843 KDM6BO15054 1643 aa33.12■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.12■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.11■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 RAPGEF3O95398 923 aa33.11■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 KDM5CP41229 1560 aa33.11■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.1■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 AFAP1Q8N556 730 aa33.09■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.08■■■□□ 2.89
STX4-201ENST00000313843 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.07■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 ADGRL2O95490 1459 aa33.06■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 TSPY4P0CV99 314 aa33.05■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 TSPY10P0CW01 314 aa33.05■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.04■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.04■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 ATP7AQ04656 1500 aa33.03■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 PLXNC1O60486 1568 aa33.03■■■□□ 2.88
STX4-201ENST00000313843 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 ROCK1Q13464 1354 aa33■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.99■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.98■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 NCOA1Q15788 1441 aa32.97■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.97■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.96■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 HFM1A2PYH4 1435 aa32.96■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.96■■■□□ 2.87
STX4-201ENST00000313843 ABCA6Q8N139 1617 aa32.94■■■□□ 2.86
STX4-201ENST00000313843 NAIPQ13075 1403 aa32.94■■■□□ 2.86
STX4-201ENST00000313843 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.94■■■□□ 2.86
STX4-201ENST00000313843 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.91■■■□□ 2.86
STX4-201ENST00000313843 KIF15Q9NS87 1388 aa32.89■■■□□ 2.86
STX4-201ENST00000313843 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.88■■■□□ 2.85
STX4-201ENST00000313843 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.87■■■□□ 2.85
STX4-201ENST00000313843 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
STX4-201ENST00000313843 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.84■■■□□ 2.85
STX4-201ENST00000313843 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.83■■■□□ 2.85
STX4-201ENST00000313843 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.82■■■□□ 2.84
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.8■■■□□ 2.84
STX4-201ENST00000313843 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.78■■■□□ 2.84
STX4-201ENST00000313843 ATP10AO60312 1499 aa32.74■■■□□ 2.83
STX4-201ENST00000313843 A2MP01023 1474 aa32.73■■■□□ 2.83
STX4-201ENST00000313843 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
STX4-201ENST00000313843 ERBINQ96RT1 1412 aa32.73■■■□□ 2.83
STX4-201ENST00000313843 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.7■■■□□ 2.83
STX4-201ENST00000313843 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
STX4-201ENST00000313843 REREQ9P2R6 1566 aa32.66■■■□□ 2.82
STX4-201ENST00000313843 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.66■■■□□ 2.82
STX4-201ENST00000313843 UNC13BO14795 1591 aa32.66■■■□□ 2.82
STX4-201ENST00000313843 DEPDC5O75140 1603 aa32.63■■■□□ 2.81
STX4-201ENST00000313843 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
STX4-201ENST00000313843 HRCP23327 699 aa32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms