RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PLCH2O75038 1416 aa33.6■■■□□ 2.97
CTU2-201ENST00000312060 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.58■■■□□ 2.97
CTU2-201ENST00000312060 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 GLI2P10070 1586 aa33.56■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 DIP2BQ9P265 1576 aa33.56■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.54■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.54■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 ITGAEP38570 1179 aa33.52■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 CD109Q6YHK3 1445 aa33.52■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.52■■■□□ 2.96
CTU2-201ENST00000312060 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.51■■■□□ 2.95
CTU2-201ENST00000312060 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.49■■■□□ 2.95
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.49■■■□□ 2.95
CTU2-201ENST00000312060 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.47■■■□□ 2.95
CTU2-201ENST00000312060 FANCAO15360 1455 aa33.43■■■□□ 2.94
CTU2-201ENST00000312060 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.4■■■□□ 2.94
CTU2-201ENST00000312060 TSPOAP1O95153 1857 aa33.38■■■□□ 2.93
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CTU2-201ENST00000312060 DAPK1P53355 1430 aa33.37■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.36■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 ABCC5O15440 1437 aa33.35■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 PTPRKQ15262 1439 aa33.35■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.35■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.35■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.34■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 ABCC1P33527 1531 aa33.34■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 MBD5Q9P267 1494 aa33.33■■■□□ 2.93
CTU2-201ENST00000312060 AKNAQ7Z591 1439 aa33.31■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.31■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.3■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.29■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 ADGRL1O94910 1474 aa33.28■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 NEO1Q92859 1461 aa33.27■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.27■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.26■■■□□ 2.92
CTU2-201ENST00000312060 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.24■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 TSPY4P0CV99 314 aa33.23■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 TSPY10P0CW01 314 aa33.23■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.21■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.2■■■□□ 2.91
CTU2-201ENST00000312060 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.2■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.19■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.17■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 ROCK1Q13464 1354 aa33.15■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 AFAP1Q8N556 730 aa33.14■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.14■■■□□ 2.9
CTU2-201ENST00000312060 HFM1A2PYH4 1435 aa33.13■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.13■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 ADGRL2O95490 1459 aa33.12■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.11■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.1■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 NCOA1Q15788 1441 aa33.1■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 NAIPQ13075 1403 aa33.09■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.08■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.08■■■□□ 2.89
CTU2-201ENST00000312060 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.07■■■□□ 2.88
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CTU2-201ENST00000312060 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.04■■■□□ 2.88
CTU2-201ENST00000312060 RICTORQ6R327 1708 aa33.04■■■□□ 2.88
CTU2-201ENST00000312060 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.03■■■□□ 2.88
CTU2-201ENST00000312060 RAPGEF3O95398 923 aa33.02■■■□□ 2.88
CTU2-201ENST00000312060 KDM5CP41229 1560 aa33.01■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 PLXNC1O60486 1568 aa32.99■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.99■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.98■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 ATP7AQ04656 1500 aa32.98■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 KIF15Q9NS87 1388 aa32.97■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 HRCP23327 699 aa32.96■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.95■■■□□ 2.87
CTU2-201ENST00000312060 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.93■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.93■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.93■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 KDM6BO15054 1643 aa32.92■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.9■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
CTU2-201ENST00000312060 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.87■■■□□ 2.85
CTU2-201ENST00000312060 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.85■■■□□ 2.85
CTU2-201ENST00000312060 ABCA6Q8N139 1617 aa32.79■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.78■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 ERBINQ96RT1 1412 aa32.78■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 TRIM52Q96A61 297 aa32.76■■■□□ 2.84
CTU2-201ENST00000312060 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
CTU2-201ENST00000312060 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.74■■■□□ 2.83
CTU2-201ENST00000312060 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.73■■■□□ 2.83
CTU2-201ENST00000312060 A2MP01023 1474 aa32.73■■■□□ 2.83
CTU2-201ENST00000312060 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CTU2-201ENST00000312060 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
CTU2-201ENST00000312060 ATP10AO60312 1499 aa32.64■■■□□ 2.82
CTU2-201ENST00000312060 UNC13BO14795 1591 aa32.63■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 KIF3BO15066 747 aa32.62■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 NUP155O75694 1391 aa32.61■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.6■■■□□ 2.81
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