RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.65■■■□□ 2.82
TTC9B-201ENST00000311308 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.65■■■□□ 2.82
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.63■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.62■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.62■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 PTPRMP28827 1452 aa32.61■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.6■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.6■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.59■■■□□ 2.81
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.54■■■□□ 2.8
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TTC9B-201ENST00000311308 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.46■■■□□ 2.79
TTC9B-201ENST00000311308 PREX2Q70Z35 1606 aa32.44■■■□□ 2.78
TTC9B-201ENST00000311308 MLECQ14165 292 aa32.44■■■□□ 2.78
TTC9B-201ENST00000311308 KDM5CP41229 1560 aa32.41■■■□□ 2.78
TTC9B-201ENST00000311308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.41■■■□□ 2.78
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TTC9B-201ENST00000311308 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.33■■■□□ 2.77
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TTC9B-201ENST00000311308 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.25■■■□□ 2.75
TTC9B-201ENST00000311308 REREQ9P2R6 1566 aa32.24■■■□□ 2.75
TTC9B-201ENST00000311308 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
TTC9B-201ENST00000311308 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.23■■■□□ 2.75
TTC9B-201ENST00000311308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.21■■■□□ 2.75
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TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.2■■■□□ 2.75
TTC9B-201ENST00000311308 ABCA6Q8N139 1617 aa32.19■■■□□ 2.74
TTC9B-201ENST00000311308 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.19■■■□□ 2.74
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TTC9B-201ENST00000311308 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
TTC9B-201ENST00000311308 AGLP35573 1532 aa32.16■■■□□ 2.74
TTC9B-201ENST00000311308 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.13■■■□□ 2.73
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TTC9B-201ENST00000311308 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.12■■■□□ 2.73
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TTC9B-201ENST00000311308 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
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TTC9B-201ENST00000311308 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.97■■■□□ 2.71
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TTC9B-201ENST00000311308 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.87■■■□□ 2.69
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TTC9B-201ENST00000311308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
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TTC9B-201ENST00000311308 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
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TTC9B-201ENST00000311308 PTPRKQ15262 1439 aa31.65■■■□□ 2.66
TTC9B-201ENST00000311308 PTPRTO14522 1441 aa31.63■■■□□ 2.65
TTC9B-201ENST00000311308 STRCQ7RTU9 1775 aa31.63■■■□□ 2.65
TTC9B-201ENST00000311308 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.61■■■□□ 2.65
TTC9B-201ENST00000311308 NCOA1Q15788 1441 aa31.61■■■□□ 2.65
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TTC9B-201ENST00000311308 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.57■■■□□ 2.64
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