RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.05■■□□□ 1.92
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ARHGAP5Q13017 1502 aa27■■□□□ 1.91
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TRAPPC1-201ENST00000303731 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC1-201ENST00000303731 MADDQ8WXG6 1647 aa26.94■■□□□ 1.9
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TRAPPC1-201ENST00000303731 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.86■■□□□ 1.89
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TRAPPC1-201ENST00000303731 AFAP1Q8N556 730 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC1-201ENST00000303731 CEP162Q5TB80 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC1-201ENST00000303731 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC1-201ENST00000303731 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.78■■□□□ 1.88
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC1-201ENST00000303731 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC1-201ENST00000303731 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.67■■□□□ 1.86
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.66■■□□□ 1.86
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.57■■□□□ 1.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 MAP3K1Q13233 1512 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC1-201ENST00000303731 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC1-201ENST00000303731 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC1-201ENST00000303731 MROH2AA6NES4 1674 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.42■■□□□ 1.82
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TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
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TRAPPC1-201ENST00000303731 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC1-201ENST00000303731 GGT6Q6P531 493 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC1-201ENST00000303731 STRCQ7RTU9 1775 aa26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 MIA2Q96PC5 1412 aa26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 TSPY4P0CV99 314 aa26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 TSPY10P0CW01 314 aa26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.25■■□□□ 1.79
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TRAPPC1-201ENST00000303731 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTPRTO14522 1441 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTPRKQ15262 1439 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC1-201ENST00000303731 KIF3BO15066 747 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC1-201ENST00000303731 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC1-201ENST00000303731 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.16■■□□□ 1.78
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