RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303212.2

NRTN-201, Transcript of neurturin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRTN, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTN-201ENST00000303212 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.37■■■■■ 4.85
NRTN-201ENST00000303212 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.35■■■■■ 4.85
NRTN-201ENST00000303212 CEP162Q5TB80 1403 aa45.35■■■■■ 4.85
NRTN-201ENST00000303212 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.32■■■■■ 4.85
NRTN-201ENST00000303212 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
NRTN-201ENST00000303212 PREX2Q70Z35 1606 aa45.28■■■■■ 4.84
NRTN-201ENST00000303212 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.23■■■■■ 4.83
NRTN-201ENST00000303212 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.23■■■■■ 4.83
NRTN-201ENST00000303212 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.23■■■■■ 4.83
NRTN-201ENST00000303212 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.22■■■■■ 4.83
NRTN-201ENST00000303212 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.2■■■■■ 4.83
NRTN-201ENST00000303212 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.13■■■■■ 4.82
NRTN-201ENST00000303212 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.12■■■■■ 4.81
NRTN-201ENST00000303212 KDM5CP41229 1560 aa45.1■■■■■ 4.81
NRTN-201ENST00000303212 ABCC1P33527 1531 aa45.09■■■■■ 4.81
NRTN-201ENST00000303212 PTPRMP28827 1452 aa45.08■■■■■ 4.81
NRTN-201ENST00000303212 MADDQ8WXG6 1647 aa45.08■■■■■ 4.81
NRTN-201ENST00000303212 ATP10AO60312 1499 aa45.05■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 AFAP1Q8N556 730 aa45.04■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.03■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.03■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.02■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.02■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.02■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.01■■■■■ 4.8
NRTN-201ENST00000303212 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
NRTN-201ENST00000303212 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.98■■■■■ 4.79
NRTN-201ENST00000303212 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.97■■■■■ 4.79
NRTN-201ENST00000303212 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.95■■■■■ 4.79
NRTN-201ENST00000303212 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.93■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.93■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.91■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.88■■■■■ 4.78
NRTN-201ENST00000303212 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.87■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 MLECQ14165 292 aa44.87■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.86■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.85■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 ABCA6Q8N139 1617 aa44.83■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 REREQ9P2R6 1566 aa44.83■■■■■ 4.77
NRTN-201ENST00000303212 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.82■■■■■ 4.76
NRTN-201ENST00000303212 TIAM1Q13009 1591 aa44.82■■■■■ 4.76
NRTN-201ENST00000303212 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.79■■■■■ 4.76
NRTN-201ENST00000303212 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
NRTN-201ENST00000303212 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.74■■■■■ 4.75
NRTN-201ENST00000303212 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.75
NRTN-201ENST00000303212 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
NRTN-201ENST00000303212 AGLP35573 1532 aa44.67■■■■■ 4.74
NRTN-201ENST00000303212 NCOA2Q15596 1464 aa44.66■■■■■ 4.74
NRTN-201ENST00000303212 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.65■■■■■ 4.74
NRTN-201ENST00000303212 ATP7AQ04656 1500 aa44.62■■■■■ 4.73
NRTN-201ENST00000303212 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.59■■■■■ 4.73
NRTN-201ENST00000303212 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
NRTN-201ENST00000303212 MAP3K1Q13233 1512 aa44.58■■■■■ 4.73
NRTN-201ENST00000303212 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.56■■■■■ 4.72
NRTN-201ENST00000303212 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
NRTN-201ENST00000303212 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
NRTN-201ENST00000303212 MBD5Q9P267 1494 aa44.49■■■■■ 4.71
NRTN-201ENST00000303212 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.47■■■■■ 4.71
NRTN-201ENST00000303212 A2MP01023 1474 aa44.44■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 PLXNC1O60486 1568 aa44.41■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.4■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.4■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 APLP2Q06481 763 aa44.4■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.4■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.4■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.38■■■■■ 4.7
NRTN-201ENST00000303212 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.36■■■■■ 4.69
NRTN-201ENST00000303212 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
NRTN-201ENST00000303212 C3P01024 1663 aa44.32■■■■■ 4.68
NRTN-201ENST00000303212 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.31■■■■■ 4.68
NRTN-201ENST00000303212 HSPA2P54652 639 aa44.27■■■■■ 4.68
NRTN-201ENST00000303212 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.25■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 MROH2AA6NES4 1674 aa44.25■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.24■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 MIA2Q96PC5 1412 aa44.24■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 TSPY4P0CV99 314 aa44.21■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 TSPY10P0CW01 314 aa44.21■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.67
NRTN-201ENST00000303212 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
NRTN-201ENST00000303212 GGT6Q6P531 493 aa44.18■■■■■ 4.66
NRTN-201ENST00000303212 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.14■■■■■ 4.66
NRTN-201ENST00000303212 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
NRTN-201ENST00000303212 ZMYM3Q14202 1370 aa44.11■■■■■ 4.65
NRTN-201ENST00000303212 NPATQ14207 1427 aa44.09■■■■■ 4.65
NRTN-201ENST00000303212 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.07■■■■■ 4.65
NRTN-201ENST00000303212 KIF3BO15066 747 aa44.02■■■■■ 4.64
NRTN-201ENST00000303212 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.99■■■■■ 4.63
NRTN-201ENST00000303212 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.98■■■■■ 4.63
NRTN-201ENST00000303212 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
NRTN-201ENST00000303212 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.93■■■■■ 4.62
NRTN-201ENST00000303212 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.91■■■■■ 4.62
NRTN-201ENST00000303212 PTPRKQ15262 1439 aa43.9■■■■■ 4.62
NRTN-201ENST00000303212 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.89■■■■■ 4.62
NRTN-201ENST00000303212 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.87■■■■■ 4.61
NRTN-201ENST00000303212 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.86■■■■■ 4.61
NRTN-201ENST00000303212 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms