RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303142.10

C20orf196-201, Transcript of Uncharacterized protein C20orf196, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C20orf196, Length 1,154 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf196-201ENST00000303142 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.33■■■□□ 2.29
C20orf196-201ENST00000303142 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.31■■■□□ 2.28
C20orf196-201ENST00000303142 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.3■■■□□ 2.28
C20orf196-201ENST00000303142 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.29■■■□□ 2.28
C20orf196-201ENST00000303142 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.26■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 PREX2Q70Z35 1606 aa29.25■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.25■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.24■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.21■■■□□ 2.27
C20orf196-201ENST00000303142 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.17■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.15■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.15■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.15■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.14■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 AFAP1Q8N556 730 aa29.14■■■□□ 2.26
C20orf196-201ENST00000303142 KDM5CP41229 1560 aa29.13■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 ABCC1P33527 1531 aa29.13■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.12■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 ATP10AO60312 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.12■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.1■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.09■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.08■■■□□ 2.25
C20orf196-201ENST00000303142 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.07■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.07■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.05■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.05■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.04■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 PTPRMP28827 1452 aa29.04■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.03■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 TIAM1Q13009 1591 aa29.03■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.02■■■□□ 2.24
C20orf196-201ENST00000303142 MADDQ8WXG6 1647 aa29.01■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.98■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 MAP3K1Q13233 1512 aa28.97■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 REREQ9P2R6 1566 aa28.96■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.96■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
C20orf196-201ENST00000303142 NCOA2Q15596 1464 aa28.95■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 MLECQ14165 292 aa28.94■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.93■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 ABCA6Q8N139 1617 aa28.91■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 APLP2Q06481 763 aa28.89■■■□□ 2.22
C20orf196-201ENST00000303142 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.88■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 AGLP35573 1532 aa28.87■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.84■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.84■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 ATP7AQ04656 1500 aa28.84■■■□□ 2.21
C20orf196-201ENST00000303142 MBD5Q9P267 1494 aa28.81■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.78■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.77■■■□□ 2.2
C20orf196-201ENST00000303142 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.75■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 A2MP01023 1474 aa28.74■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.74■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 MIA2Q96PC5 1412 aa28.72■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.71■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.71■■■□□ 2.19
C20orf196-201ENST00000303142 PLXNC1O60486 1568 aa28.69■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.69■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.69■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.68■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 TSPY4P0CV99 314 aa28.68■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 TSPY10P0CW01 314 aa28.68■■■□□ 2.18
C20orf196-201ENST00000303142 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
C20orf196-201ENST00000303142 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.63■■■□□ 2.17
C20orf196-201ENST00000303142 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
C20orf196-201ENST00000303142 GGT6Q6P531 493 aa28.57■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.56■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 MROH2AA6NES4 1674 aa28.55■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 C3P01024 1663 aa28.55■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.54■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.53■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 ZMYM3Q14202 1370 aa28.51■■■□□ 2.16
C20orf196-201ENST00000303142 HSPA2P54652 639 aa28.51■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 KIF3BO15066 747 aa28.5■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 NPATQ14207 1427 aa28.5■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.49■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.48■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.47■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
C20orf196-201ENST00000303142 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
C20orf196-201ENST00000303142 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.44■■■□□ 2.14
C20orf196-201ENST00000303142 ABCC5O15440 1437 aa28.4■■■□□ 2.14
C20orf196-201ENST00000303142 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.39■■■□□ 2.13
C20orf196-201ENST00000303142 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.38■■■□□ 2.13
C20orf196-201ENST00000303142 DAPK1P53355 1430 aa28.38■■■□□ 2.13
C20orf196-201ENST00000303142 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms