RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299736.4

CENPV-201, Transcript of centromere protein V, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPV, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-201ENST00000299736 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.65■■■■■ 4.26
CENPV-201ENST00000299736 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.65■■■■■ 4.26
CENPV-201ENST00000299736 KIF14Q15058 1648 aa41.65■■■■■ 4.26
CENPV-201ENST00000299736 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.63■■■■■ 4.25
CENPV-201ENST00000299736 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CENPV-201ENST00000299736 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.61■■■■■ 4.25
CENPV-201ENST00000299736 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.6■■■■■ 4.25
CENPV-201ENST00000299736 CLIP1P30622 1438 aa41.56■■■■■ 4.24
CENPV-201ENST00000299736 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
CENPV-201ENST00000299736 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.49■■■■■ 4.23
CENPV-201ENST00000299736 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.48■■■■■ 4.23
CENPV-201ENST00000299736 ATP10AO60312 1499 aa41.45■■■■■ 4.23
CENPV-201ENST00000299736 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.45■■■■■ 4.23
CENPV-201ENST00000299736 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.44■■■■■ 4.23
CENPV-201ENST00000299736 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.44■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.44■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.42■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.41■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 MLECQ14165 292 aa41.39■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 KDM5CP41229 1560 aa41.38■■■■■ 4.22
CENPV-201ENST00000299736 PREX2Q70Z35 1606 aa41.34■■■■■ 4.21
CENPV-201ENST00000299736 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
CENPV-201ENST00000299736 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.33■■■■■ 4.21
CENPV-201ENST00000299736 AFAP1Q8N556 730 aa41.31■■■■■ 4.2
CENPV-201ENST00000299736 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.29■■■■■ 4.2
CENPV-201ENST00000299736 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.24■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 ABCC1P33527 1531 aa41.23■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.23■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.22■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.21■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.21■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 REREQ9P2R6 1566 aa41.2■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 HSPA2P54652 639 aa41.2■■■■■ 4.19
CENPV-201ENST00000299736 FBXO41Q8TF61 875 aa41.18■■■■■ 4.18
CENPV-201ENST00000299736 ABCA6Q8N139 1617 aa41.18■■■■■ 4.18
CENPV-201ENST00000299736 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.15■■■■■ 4.18
CENPV-201ENST00000299736 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.12■■■■■ 4.17
CENPV-201ENST00000299736 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.07■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 AGLP35573 1532 aa41.06■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.02■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
CENPV-201ENST00000299736 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
CENPV-201ENST00000299736 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.95■■■■■ 4.15
CENPV-201ENST00000299736 C3P01024 1663 aa40.94■■■■■ 4.14
CENPV-201ENST00000299736 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.91■■■■■ 4.14
CENPV-201ENST00000299736 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
CENPV-201ENST00000299736 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.87■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.87■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.86■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.86■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.83■■■■■ 4.13
CENPV-201ENST00000299736 STRCQ7RTU9 1775 aa40.81■■■■■ 4.12
CENPV-201ENST00000299736 ATP7AQ04656 1500 aa40.8■■■■■ 4.12
CENPV-201ENST00000299736 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CENPV-201ENST00000299736 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
CENPV-201ENST00000299736 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.76■■■■■ 4.12
CENPV-201ENST00000299736 CERKQ8TCT0 537 aa40.75■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 MROH2AA6NES4 1674 aa40.75■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.74■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 TIAM1Q13009 1591 aa40.74■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 CEP162Q5TB80 1403 aa40.73■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 PLXNC1O60486 1568 aa40.7■■■■■ 4.11
CENPV-201ENST00000299736 A2MP01023 1474 aa40.67■■■■■ 4.1
CENPV-201ENST00000299736 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.63■■■■■ 4.1
CENPV-201ENST00000299736 NPATQ14207 1427 aa40.62■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 ZMYM3Q14202 1370 aa40.6■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 MBD5Q9P267 1494 aa40.58■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 PTPRTO14522 1441 aa40.58■■■■■ 4.09
CENPV-201ENST00000299736 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.5■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 NCOA1Q15788 1441 aa40.5■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 GGT6Q6P531 493 aa40.49■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 NCOA2Q15596 1464 aa40.48■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.46■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.45■■■■■ 4.07
CENPV-201ENST00000299736 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.42■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 PTPRKQ15262 1439 aa40.42■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.41■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.41■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CENPV-201ENST00000299736 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.36■■■■■ 4.05
CENPV-201ENST00000299736 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CENPV-201ENST00000299736 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.33■■■■■ 4.05
CENPV-201ENST00000299736 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.33■■■■■ 4.05
CENPV-201ENST00000299736 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.29■■■■■ 4.04
CENPV-201ENST00000299736 PLA2R1Q13018 1463 aa40.29■■■■■ 4.04
CENPV-201ENST00000299736 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.26■■■■■ 4.04
CENPV-201ENST00000299736 KIF3BO15066 747 aa40.25■■■■■ 4.03
CENPV-201ENST00000299736 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.25■■■■■ 4.03
CENPV-201ENST00000299736 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.24■■■■■ 4.03
CENPV-201ENST00000299736 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.24■■■■■ 4.03
CENPV-201ENST00000299736 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.23■■■■■ 4.03
CENPV-201ENST00000299736 PKD2Q13563 968 aa40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms