RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.8■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 TSPOAP1O95153 1857 aa27.8■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.78■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.78■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 FANCAO15360 1455 aa27.77■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 MIA2Q96PC5 1412 aa27.77■■■□□ 2.04
TMED3-201ENST00000299705 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.76■■■□□ 2.03
TMED3-201ENST00000299705 NEO1Q92859 1461 aa27.76■■■□□ 2.03
TMED3-201ENST00000299705 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.7■■■□□ 2.03
TMED3-201ENST00000299705 AKNAQ7Z591 1439 aa27.7■■■□□ 2.02
TMED3-201ENST00000299705 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
TMED3-201ENST00000299705 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
TMED3-201ENST00000299705 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.65■■■□□ 2.02
TMED3-201ENST00000299705 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.64■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.63■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 ADGRL1O94910 1474 aa27.62■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.62■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 ABCC1P33527 1531 aa27.61■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.59■■■□□ 2.01
TMED3-201ENST00000299705 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.56■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.55■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 MBD5Q9P267 1494 aa27.54■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 22e-6■■■□□ 16.3
TMED3-201ENST00000299705 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.53■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.51■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
TMED3-201ENST00000299705 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.5■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 KDM6BO15054 1643 aa27.5■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.49■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.49■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 RICTORQ6R327 1708 aa27.48■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 RAPGEF3O95398 923 aa27.47■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.47■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 AFAP1Q8N556 730 aa27.45■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.45■■□□□ 1.99
TMED3-201ENST00000299705 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 KDM5CP41229 1560 aa27.44■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 ABCC5O15440 1437 aa27.42■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 DAPK1P53355 1430 aa27.42■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.4■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 TSPY4P0CV99 314 aa27.39■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 TSPY10P0CW01 314 aa27.39■■□□□ 1.98
TMED3-201ENST00000299705 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.38■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.38■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.37■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.36■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.36■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.36■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.34■■□□□ 1.97
TMED3-201ENST00000299705 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.32■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 ATP7AQ04656 1500 aa27.31■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.31■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 PTPRKQ15262 1439 aa27.31■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.3■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 ITGAEP38570 1179 aa27.29■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 ADGRL2O95490 1459 aa27.27■■□□□ 1.96
TMED3-201ENST00000299705 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.26■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.25■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ROCK1Q13464 1354 aa27.24■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 PLXNC1O60486 1568 aa27.24■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.24■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.24■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.24■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 NCOA1Q15788 1441 aa27.23■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.22■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.21■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ABCA6Q8N139 1617 aa27.21■■□□□ 1.95
TMED3-201ENST00000299705 ATP10AO60312 1499 aa27.19■■□□□ 1.94
TMED3-201ENST00000299705 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.16■■□□□ 1.94
TMED3-201ENST00000299705 KIF15Q9NS87 1388 aa27.16■■□□□ 1.94
TMED3-201ENST00000299705 REREQ9P2R6 1566 aa27.15■■□□□ 1.94
TMED3-201ENST00000299705 A2MP01023 1474 aa27.14■■□□□ 1.93
TMED3-201ENST00000299705 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.14■■□□□ 1.93
TMED3-201ENST00000299705 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TMED3-201ENST00000299705 HFM1A2PYH4 1435 aa27.1■■□□□ 1.93
TMED3-201ENST00000299705 NAIPQ13075 1403 aa27.08■■□□□ 1.93
TMED3-201ENST00000299705 ERBINQ96RT1 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
TMED3-201ENST00000299705 AGLP35573 1532 aa27.06■■□□□ 1.92
TMED3-201ENST00000299705 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.05■■□□□ 1.92
TMED3-201ENST00000299705 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.05■■□□□ 1.92
TMED3-201ENST00000299705 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TMED3-201ENST00000299705 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.01■■□□□ 1.91
TMED3-201ENST00000299705 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.01■■□□□ 1.91
TMED3-201ENST00000299705 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.98■■□□□ 1.91
TMED3-201ENST00000299705 KIF3BO15066 747 aa26.97■■□□□ 1.91
TMED3-201ENST00000299705 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.94■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 HRCP23327 699 aa26.9■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms