RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CLIP1P30622 1438 aa12.35□□□□□ -0.43
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.32□□□□□ -0.44
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DIP2BQ9P265 1576 aa12.32□□□□□ -0.44
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TSPOAP1O95153 1857 aa12.18□□□□□ -0.46
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.91□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KDM5CP41229 1560 aa11.91□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPDYE6P0CI01 402 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.9□□□□□ -0.51
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.9□□□□□ -0.51
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MBD5Q9P267 1494 aa11.88□□□□□ -0.51
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