RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.14■■■□□ 2.74
CXCL3-201ENST00000296026 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.11■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 CLIP1P30622 1438 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.04■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 MLECQ14165 292 aa31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 ATP10AO60312 1499 aa31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.95■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.94■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.92■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 AFAP1Q8N556 730 aa31.92■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 KDM5CP41229 1560 aa31.9■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 PREX2Q70Z35 1606 aa31.89■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.89■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.85■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.83■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC1P33527 1531 aa31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.8■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.79■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.77■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA2P54652 639 aa31.76■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 ABCA6Q8N139 1617 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 REREQ9P2R6 1566 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 AGLP35573 1532 aa31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO41Q8TF61 875 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.58■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 CEP162Q5TB80 1403 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.53■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 C3P01024 1663 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.5■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 ATP7AQ04656 1500 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 TIAM1Q13009 1591 aa31.47■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 A2MP01023 1474 aa31.39■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 STRCQ7RTU9 1775 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNC1O60486 1568 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 MROH2AA6NES4 1674 aa31.36■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 MBD5Q9P267 1494 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 CERKQ8TCT0 537 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYM3Q14202 1370 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA2Q15596 1464 aa31.31■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 NPATQ14207 1427 aa31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 GGT6Q6P531 493 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.26■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRTO14522 1441 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.19■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA1Q15788 1441 aa31.18■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.17■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRKQ15262 1439 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 KIF3BO15066 747 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY4P0CV99 314 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY10P0CW01 314 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K1Q13233 1512 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms