RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.08■■■■□ 3.69
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PQLC3-201ENST00000295083 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
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PQLC3-201ENST00000295083 MIA2Q96PC5 1412 aa37.98■■■■□ 3.67
PQLC3-201ENST00000295083 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.96■■■■□ 3.67
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PQLC3-201ENST00000295083 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.89■■■■□ 3.66
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PQLC3-201ENST00000295083 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.88■■■■□ 3.65
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PQLC3-201ENST00000295083 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.79■■■■□ 3.64
PQLC3-201ENST00000295083 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.78■■■■□ 3.64
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PQLC3-201ENST00000295083 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
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PQLC3-201ENST00000295083 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.72■■■■□ 3.63
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PQLC3-201ENST00000295083 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.69■■■■□ 3.62
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PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.64■■■■□ 3.62
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PQLC3-201ENST00000295083 ABCC5O15440 1437 aa37.62■■■■□ 3.61
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PQLC3-201ENST00000295083 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.61■■■■□ 3.61
PQLC3-201ENST00000295083 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.61■■■■□ 3.61
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.6■■■■□ 3.61
PQLC3-201ENST00000295083 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.6■■■■□ 3.61
PQLC3-201ENST00000295083 KDM6BO15054 1643 aa37.6■■■■□ 3.61
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PQLC3-201ENST00000295083 PTPRKQ15262 1439 aa37.56■■■■□ 3.6
PQLC3-201ENST00000295083 TSPY4P0CV99 314 aa37.53■■■■□ 3.6
PQLC3-201ENST00000295083 TSPY10P0CW01 314 aa37.53■■■■□ 3.6
PQLC3-201ENST00000295083 KDM5CP41229 1560 aa37.53■■■■□ 3.6
PQLC3-201ENST00000295083 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.52■■■■□ 3.6
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PQLC3-201ENST00000295083 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.47■■■■□ 3.59
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PQLC3-201ENST00000295083 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.44■■■■□ 3.58
PQLC3-201ENST00000295083 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.44■■■■□ 3.58
PQLC3-201ENST00000295083 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.42■■■■□ 3.58
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PQLC3-201ENST00000295083 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
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PQLC3-201ENST00000295083 ATP7AQ04656 1500 aa37.4■■■■□ 3.58
PQLC3-201ENST00000295083 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.39■■■■□ 3.58
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PQLC3-201ENST00000295083 ABCA6Q8N139 1617 aa37.3■■■■□ 3.56
PQLC3-201ENST00000295083 ROCK1Q13464 1354 aa37.28■■■■□ 3.56
PQLC3-201ENST00000295083 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.26■■■■□ 3.56
PQLC3-201ENST00000295083 PLXNC1O60486 1568 aa37.26■■■■□ 3.56
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PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.09■■■■□ 3.53
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PQLC3-201ENST00000295083 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.03■■■■□ 3.52
PQLC3-201ENST00000295083 KIF3BO15066 747 aa37.01■■■■□ 3.51
PQLC3-201ENST00000295083 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
PQLC3-201ENST00000295083 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.96■■■■□ 3.51
PQLC3-201ENST00000295083 AGLP35573 1532 aa36.96■■■■□ 3.51
PQLC3-201ENST00000295083 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
PQLC3-201ENST00000295083 GGT6Q6P531 493 aa36.9■■■■□ 3.5
PQLC3-201ENST00000295083 MLECQ14165 292 aa36.89■■■■□ 3.5
PQLC3-201ENST00000295083 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.89■■■■□ 3.5
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