RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293308.11

KRT8-201, Transcript of keratin 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KRT8, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8-201ENST00000293308 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.89■■□□□ 1.58
KRT8-201ENST00000293308 KIF14Q15058 1648 aa24.87■■□□□ 1.57
KRT8-201ENST00000293308 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.86■■□□□ 1.57
KRT8-201ENST00000293308 DIP2BQ9P265 1576 aa24.85■■□□□ 1.57
KRT8-201ENST00000293308 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
KRT8-201ENST00000293308 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.83■■□□□ 1.56
KRT8-201ENST00000293308 HFM1A2PYH4 1435 aa24.81■■□□□ 1.56
KRT8-201ENST00000293308 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
KRT8-201ENST00000293308 GLI2P10070 1586 aa24.78■■□□□ 1.56
KRT8-201ENST00000293308 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.562e-7■□□□□ 8.1
KRT8-201ENST00000293308 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.77■■□□□ 1.56
KRT8-201ENST00000293308 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.76■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.76■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 MYT1Q01538 1121 aa24.76■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.75■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.75■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 NCOA2Q15596 1464 aa24.74■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.73■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 CD109Q6YHK3 1445 aa24.71■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.71■■□□□ 1.55
KRT8-201ENST00000293308 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.68■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 PTPRKQ15262 1439 aa24.67■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 NAIPQ13075 1403 aa24.66■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 TSPOAP1O95153 1857 aa24.66■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
KRT8-201ENST00000293308 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.64■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.63■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 PREX2Q70Z35 1606 aa24.63■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 PLCH2O75038 1416 aa24.62■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.62■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 AKNAQ7Z591 1439 aa24.62■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 TONSLQ96HA7 1378 aa24.61■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 CCER2I3L3R5 266 aa24.61■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.6■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.59■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.58■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
KRT8-201ENST00000293308 FANCAO15360 1455 aa24.58■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.56■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.56■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.55■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 MIA2Q96PC5 1412 aa24.54■■□□□ 1.52
KRT8-201ENST00000293308 NEO1Q92859 1461 aa24.51■■□□□ 1.51
KRT8-201ENST00000293308 ANP32CO43423 234 aa24.47■■□□□ 1.51
KRT8-201ENST00000293308 ADGRL1O94910 1474 aa24.46■■□□□ 1.51
KRT8-201ENST00000293308 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
KRT8-201ENST00000293308 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.46■■□□□ 1.51
KRT8-201ENST00000293308 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
KRT8-201ENST00000293308 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.43■■□□□ 1.5
KRT8-201ENST00000293308 ABCC1P33527 1531 aa24.42■■□□□ 1.5
KRT8-201ENST00000293308 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
KRT8-201ENST00000293308 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.4■■□□□ 1.5
KRT8-201ENST00000293308 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.37■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 ROCK1Q13464 1354 aa24.36■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 KDM6BO15054 1643 aa24.36■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.34■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.33■■□□□ 1.49
KRT8-201ENST00000293308 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.32■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 RAPGEF3O95398 923 aa24.32■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 MBD5Q9P267 1494 aa24.31■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.3■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.3■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 RICTORQ6R327 1708 aa24.29■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.28■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 AFAP1Q8N556 730 aa24.28■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.28■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
KRT8-201ENST00000293308 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.26■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 DAPK1P53355 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.25■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.25■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 TSPY4P0CV99 314 aa24.24■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 TSPY10P0CW01 314 aa24.24■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.24■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 KDM5CP41229 1560 aa24.24■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 ABCC5O15440 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.22■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.21■■□□□ 1.47
KRT8-201ENST00000293308 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.2■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 NEFLP07196 543 aa24.2■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 TRIM52Q96A61 297 aa24.2■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.2■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.19■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.19■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 FKBP8Q14318 412 aa24.19■■□□□ 1.46
KRT8-201ENST00000293308 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms