RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253968.10

BARX1-201, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-201ENST00000253968 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.21■■■■■ 4.03
BARX1-201ENST00000253968 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.2■■■■■ 4.03
BARX1-201ENST00000253968 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.18■■■■■ 4.02
BARX1-201ENST00000253968 FANCAO15360 1455 aa40.17■■■■■ 4.02
BARX1-201ENST00000253968 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
BARX1-201ENST00000253968 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
BARX1-201ENST00000253968 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.12■■■■■ 4.01
BARX1-201ENST00000253968 NEO1Q92859 1461 aa40.1■■■■■ 4.01
BARX1-201ENST00000253968 MIA2Q96PC5 1412 aa40.08■■■■■ 4.01
BARX1-201ENST00000253968 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.07■■■■■ 4
BARX1-201ENST00000253968 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
BARX1-201ENST00000253968 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.04■■■■■ 4
BARX1-201ENST00000253968 AKNAQ7Z591 1439 aa40.03■■■■■ 4
BARX1-201ENST00000253968 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.98■■■■□ 3.99
BARX1-201ENST00000253968 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.98■■■■□ 3.99
BARX1-201ENST00000253968 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
BARX1-201ENST00000253968 ADGRL1O94910 1474 aa39.97■■■■□ 3.99
BARX1-201ENST00000253968 ABCC1P33527 1531 aa39.96■■■■□ 3.99
BARX1-201ENST00000253968 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.93■■■■□ 3.98
BARX1-201ENST00000253968 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
BARX1-201ENST00000253968 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.9■■■■□ 3.98
BARX1-201ENST00000253968 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.89■■■■□ 3.98
BARX1-201ENST00000253968 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.89■■■■□ 3.98
BARX1-201ENST00000253968 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.87■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
BARX1-201ENST00000253968 KDM6BO15054 1643 aa39.81■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 MBD5Q9P267 1494 aa39.81■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.78■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.77■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 RICTORQ6R327 1708 aa39.77■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.76■■■■□ 3.96
BARX1-201ENST00000253968 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.74■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.74■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 RAPGEF3O95398 923 aa39.74■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.72■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 AFAP1Q8N556 730 aa39.7■■■■□ 3.95
BARX1-201ENST00000253968 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.68■■■■□ 3.94
BARX1-201ENST00000253968 KDM5CP41229 1560 aa39.67■■■■□ 3.94
BARX1-201ENST00000253968 DAPK1P53355 1430 aa39.65■■■■□ 3.94
BARX1-201ENST00000253968 ABCC5O15440 1437 aa39.64■■■■□ 3.94
BARX1-201ENST00000253968 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.63■■■■□ 3.93
BARX1-201ENST00000253968 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.62■■■■□ 3.93
BARX1-201ENST00000253968 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.57■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.56■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 TSPY4P0CV99 314 aa39.55■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 TSPY10P0CW01 314 aa39.55■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.54■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.53■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.53■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 ITGAEP38570 1179 aa39.53■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.53■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 ATP7AQ04656 1500 aa39.51■■■■□ 3.92
BARX1-201ENST00000253968 PTPRKQ15262 1439 aa39.51■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.5■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.5■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.48■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.45■■■■□ 3.91
BARX1-201ENST00000253968 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.44■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.43■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.41■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 ABCA6Q8N139 1617 aa39.41■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 ADGRL2O95490 1459 aa39.39■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 PLXNC1O60486 1568 aa39.38■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.38■■■■□ 3.9
BARX1-201ENST00000253968 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
BARX1-201ENST00000253968 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.35■■■■□ 3.89
BARX1-201ENST00000253968 NCOA1Q15788 1441 aa39.34■■■■□ 3.89
BARX1-201ENST00000253968 ROCK1Q13464 1354 aa39.33■■■■□ 3.89
BARX1-201ENST00000253968 ATP10AO60312 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
BARX1-201ENST00000253968 KIF15Q9NS87 1388 aa39.28■■■■□ 3.88
BARX1-201ENST00000253968 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.28■■■■□ 3.88
BARX1-201ENST00000253968 A2MP01023 1474 aa39.24■■■■□ 3.87
BARX1-201ENST00000253968 REREQ9P2R6 1566 aa39.22■■■■□ 3.87
BARX1-201ENST00000253968 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.22■■■■□ 3.87
BARX1-201ENST00000253968 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
BARX1-201ENST00000253968 HFM1A2PYH4 1435 aa39.16■■■■□ 3.86
BARX1-201ENST00000253968 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.15■■■■□ 3.86
BARX1-201ENST00000253968 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.15■■■■□ 3.86
BARX1-201ENST00000253968 NAIPQ13075 1403 aa39.14■■■■□ 3.86
BARX1-201ENST00000253968 ERBINQ96RT1 1412 aa39.12■■■■□ 3.85
BARX1-201ENST00000253968 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.1■■■■□ 3.85
BARX1-201ENST00000253968 AGLP35573 1532 aa39.08■■■■□ 3.85
BARX1-201ENST00000253968 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
BARX1-201ENST00000253968 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.03■■■■□ 3.84
BARX1-201ENST00000253968 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
BARX1-201ENST00000253968 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.99■■■■□ 3.83
BARX1-201ENST00000253968 KIF3BO15066 747 aa38.99■■■■□ 3.83
BARX1-201ENST00000253968 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.98■■■■□ 3.83
BARX1-201ENST00000253968 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
BARX1-201ENST00000253968 DEPDC5O75140 1603 aa38.9■■■■□ 3.82
BARX1-201ENST00000253968 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.88■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms