RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 CEP162Q5TB80 1403 aa27.54■■■□□ 2
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.52■■■□□ 2
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 PREX2Q70Z35 1606 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXC6-201ENST00000243108 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXC6-201ENST00000243108 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 AFAP1Q8N556 730 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 KDM5CP41229 1560 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 MADDQ8WXG6 1647 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC1P33527 1531 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 PTPRMP28827 1452 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.33■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 ATP10AO60312 1499 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA6Q8N139 1617 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 TIAM1Q13009 1591 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 MLECQ14165 292 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC6-201ENST00000243108 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 REREQ9P2R6 1566 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC6-201ENST00000243108 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXC6-201ENST00000243108 NCOA2Q15596 1464 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC6-201ENST00000243108 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXC6-201ENST00000243108 AGLP35573 1532 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 MBD5Q9P267 1494 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 ATP7AQ04656 1500 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 MAP3K1Q13233 1512 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC6-201ENST00000243108 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXC6-201ENST00000243108 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXC6-201ENST00000243108 PLXNC1O60486 1568 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXC6-201ENST00000243108 A2MP01023 1474 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 C3P01024 1663 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 HSPA2P54652 639 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXC6-201ENST00000243108 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC6-201ENST00000243108 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXC6-201ENST00000243108 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC6-201ENST00000243108 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 MROH2AA6NES4 1674 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 MIA2Q96PC5 1412 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 GGT6Q6P531 493 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 APLP2Q06481 763 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 ZMYM3Q14202 1370 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXC6-201ENST00000243108 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 TSPY4P0CV99 314 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 TSPY10P0CW01 314 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 STRCQ7RTU9 1775 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXC6-201ENST00000243108 KIF3BO15066 747 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 NPATQ14207 1427 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 PTPRKQ15262 1439 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC5O15440 1437 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC6-201ENST00000243108 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms