RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.75□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 MS4A1P11836 297 aa8.75□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 GPATCH3Q96I76 525 aa8.74□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.74□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.72□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.72□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.72□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 NBR1Q14596 966 aa8.71□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.71□□□□□ -1.01
NDUFS1-201ENST00000233190 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 TPM2P07951 284 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXO3Q9UK99 471 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 CLIP1P30622 1438 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXW7Q969H0 707 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 WDR70Q9NW82 654 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RAD21O60216 631 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 VPS37DQ86XT2 251 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.69□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 ODF2Q5BJF6 829 aa8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 PDE4CQ08493 712 aa8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 SOX12O15370 315 aa8.66□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 WWC1Q8IX03 1113 aa8.66□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.65□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.65□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NDUFS1-201ENST00000233190 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.64□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.64□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 DRC7Q8IY82 874 aa8.64□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 PLCB2Q00722 1185 aa8.63□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.63□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 IL27Q8NEV9 243 aa8.62□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 KIF3AQ9Y496 699 aa8.62□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 SCRIBQ14160 1630 aa8.62□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 ATF3P18847 181 aa8.62□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 RFX1P22670 979 aa8.61□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.6□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 DESP17661 470 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 TOMM22Q9NS69 142 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 DRC1Q96MC2 740 aa8.59□□□□□ -1.03
NDUFS1-201ENST00000233190 CRBNQ96SW2 442 aa8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 TPM3P06753 285 aa8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.57□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.56□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 STK31Q9BXU1 1019 aa8.56□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 RGL3Q3MIN7 710 aa8.56□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 AMPHP49418 695 aa8.55□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 AK7Q96M32 723 aa8.55□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.55□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 MIER1Q8N108 512 aa8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 HRCP23327 699 aa8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.53□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.53□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 ERICH2A1L162 156 aa8.53□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 TPM1P09493 284 aa8.53□□□□□ -1.04
NDUFS1-201ENST00000233190 NEBLO76041 1014 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms