RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219548.8

STUB1-201, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STUB1, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-201ENST00000219548 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.45■■■■■ 4.23
STUB1-201ENST00000219548 FANCAO15360 1455 aa41.44■■■■■ 4.22
STUB1-201ENST00000219548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.41■■■■■ 4.22
STUB1-201ENST00000219548 NEO1Q92859 1461 aa41.36■■■■■ 4.21
STUB1-201ENST00000219548 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.34■■■■■ 4.21
STUB1-201ENST00000219548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.34■■■■■ 4.21
STUB1-201ENST00000219548 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 AKNAQ7Z591 1439 aa41.31■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.3■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.28■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 KDM6BO15054 1643 aa41.28■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
STUB1-201ENST00000219548 ADGRL1O94910 1474 aa41.24■■■■■ 4.19
STUB1-201ENST00000219548 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
STUB1-201ENST00000219548 ABCC1P33527 1531 aa41.2■■■■■ 4.19
STUB1-201ENST00000219548 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 MIA2Q96PC5 1412 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.15■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.14■■■■■ 4.18
STUB1-201ENST00000219548 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.13■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 RICTORQ6R327 1708 aa41.12■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.11■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.1■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.08■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 RAPGEF3O95398 923 aa41.08■■■■■ 4.17
STUB1-201ENST00000219548 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.05■■■■■ 4.16
STUB1-201ENST00000219548 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.164e-6■□□□□ 8.7
STUB1-201ENST00000219548 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.03■■■■■ 4.16
STUB1-201ENST00000219548 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.01■■■■■ 4.16
STUB1-201ENST00000219548 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
STUB1-201ENST00000219548 MBD5Q9P267 1494 aa40.98■■■■■ 4.15
STUB1-201ENST00000219548 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.97■■■■■ 4.15
STUB1-201ENST00000219548 AFAP1Q8N556 730 aa40.95■■■■■ 4.15
STUB1-201ENST00000219548 KDM5CP41229 1560 aa40.94■■■■■ 4.14
STUB1-201ENST00000219548 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.91■■■■■ 4.14
STUB1-201ENST00000219548 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.9■■■■■ 4.14
STUB1-201ENST00000219548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
STUB1-201ENST00000219548 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.88■■■■■ 4.13
STUB1-201ENST00000219548 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
STUB1-201ENST00000219548 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.84■■■■■ 4.13
STUB1-201ENST00000219548 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
STUB1-201ENST00000219548 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.81■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.79■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.77■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.76■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.76■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 ABCC5O15440 1437 aa40.76■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 DAPK1P53355 1430 aa40.76■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
STUB1-201ENST00000219548 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.75■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.75■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.74■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 ATP7AQ04656 1500 aa40.74■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.74■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 ABCA6Q8N139 1617 aa40.71■■■■■ 4.11
STUB1-201ENST00000219548 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.68■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.67■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 TSPY4P0CV99 314 aa40.67■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 TSPY10P0CW01 314 aa40.67■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.67■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.66■■■■■ 4.1
STUB1-201ENST00000219548 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.63■■■■■ 4.09
STUB1-201ENST00000219548 ITGAEP38570 1179 aa40.62■■■■■ 4.09
STUB1-201ENST00000219548 PTPRKQ15262 1439 aa40.6■■■■■ 4.09
STUB1-201ENST00000219548 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.59■■■■■ 4.09
STUB1-201ENST00000219548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.58■■■■■ 4.09
STUB1-201ENST00000219548 ATP10AO60312 1499 aa40.56■■■■■ 4.08
STUB1-201ENST00000219548 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.55■■■■■ 4.08
STUB1-201ENST00000219548 PLXNC1O60486 1568 aa40.54■■■■■ 4.08
STUB1-201ENST00000219548 ADGRL2O95490 1459 aa40.48■■■■■ 4.07
STUB1-201ENST00000219548 REREQ9P2R6 1566 aa40.46■■■■■ 4.07
STUB1-201ENST00000219548 A2MP01023 1474 aa40.45■■■■■ 4.07
STUB1-201ENST00000219548 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.44■■■■■ 4.06
STUB1-201ENST00000219548 NCOA1Q15788 1441 aa40.43■■■■■ 4.06
STUB1-201ENST00000219548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.42■■■■■ 4.06
STUB1-201ENST00000219548 KIF15Q9NS87 1388 aa40.41■■■■■ 4.06
STUB1-201ENST00000219548 ROCK1Q13464 1354 aa40.36■■■■■ 4.05
STUB1-201ENST00000219548 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.36■■■■■ 4.05
STUB1-201ENST00000219548 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
STUB1-201ENST00000219548 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
STUB1-201ENST00000219548 AGLP35573 1532 aa40.31■■■■■ 4.04
STUB1-201ENST00000219548 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.26■■■■■ 4.04
STUB1-201ENST00000219548 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
STUB1-201ENST00000219548 ERBINQ96RT1 1412 aa40.23■■■■■ 4.03
STUB1-201ENST00000219548 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.23■■■■■ 4.03
STUB1-201ENST00000219548 MLECQ14165 292 aa40.21■■■■■ 4.03
STUB1-201ENST00000219548 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.19■■■■■ 4.02
STUB1-201ENST00000219548 KIF3BO15066 747 aa40.19■■■■■ 4.02
STUB1-201ENST00000219548 NAIPQ13075 1403 aa40.16■■■■■ 4.02
STUB1-201ENST00000219548 HFM1A2PYH4 1435 aa40.15■■■■■ 4.02
STUB1-201ENST00000219548 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
STUB1-201ENST00000219548 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
STUB1-201ENST00000219548 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.12■■■■■ 4.01
STUB1-201ENST00000219548 GGT6Q6P531 493 aa40.11■■■■■ 4.01
STUB1-201ENST00000219548 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms