RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217402.2

CHMP4B-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4B, Length 1,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4B-201ENST00000217402 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CHMP4B-201ENST00000217402 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
CHMP4B-201ENST00000217402 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.96■■■■■ 4.31
CHMP4B-201ENST00000217402 FANCAO15360 1455 aa41.93■■■■■ 4.3
CHMP4B-201ENST00000217402 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
CHMP4B-201ENST00000217402 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.9■■■■■ 4.3
CHMP4B-201ENST00000217402 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.9■■■■■ 4.3
CHMP4B-201ENST00000217402 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.88■■■■■ 4.29
CHMP4B-201ENST00000217402 MIA2Q96PC5 1412 aa41.87■■■■■ 4.29
CHMP4B-201ENST00000217402 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.84■■■■■ 4.29
CHMP4B-201ENST00000217402 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
CHMP4B-201ENST00000217402 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.82■■■■■ 4.29
CHMP4B-201ENST00000217402 NEO1Q92859 1461 aa41.81■■■■■ 4.28
CHMP4B-201ENST00000217402 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.8■■■■■ 4.28
CHMP4B-201ENST00000217402 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.79■■■■■ 4.28
CHMP4B-201ENST00000217402 AKNAQ7Z591 1439 aa41.78■■■■■ 4.28
CHMP4B-201ENST00000217402 ADGRL1O94910 1474 aa41.74■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCC1P33527 1531 aa41.72■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.69■■■■■ 4.27
CHMP4B-201ENST00000217402 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.68■■■■■ 4.26
CHMP4B-201ENST00000217402 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.67■■■■■ 4.26
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.66■■■■■ 4.26
CHMP4B-201ENST00000217402 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.269e-7■■□□□ 12.5
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CHMP4B-201ENST00000217402 MBD5Q9P267 1494 aa41.58■■■■■ 4.25
CHMP4B-201ENST00000217402 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.55■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.52■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 RAPGEF3O95398 923 aa41.51■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.51■■■■■ 4.24
CHMP4B-201ENST00000217402 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.49■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 AFAP1Q8N556 730 aa41.49■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM6BO15054 1643 aa41.49■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 ITGAEP38570 1179 aa41.47■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.47■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 DAPK1P53355 1430 aa41.46■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.46■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCC5O15440 1437 aa41.45■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 RICTORQ6R327 1708 aa41.45■■■■■ 4.23
CHMP4B-201ENST00000217402 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.42■■■■■ 4.22
CHMP4B-201ENST00000217402 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.38■■■■■ 4.22
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM5CP41229 1560 aa41.38■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 TSPY4P0CV99 314 aa41.35■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 TSPY10P0CW01 314 aa41.35■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 PTPRKQ15262 1439 aa41.34■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.33■■■■■ 4.21
CHMP4B-201ENST00000217402 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.32■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.32■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.31■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.29■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.29■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.27■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.26■■■■■ 4.2
CHMP4B-201ENST00000217402 ATP7AQ04656 1500 aa41.26■■■■■ 4.19
CHMP4B-201ENST00000217402 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.24■■■■■ 4.19
CHMP4B-201ENST00000217402 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.21■■■■■ 4.19
CHMP4B-201ENST00000217402 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.2■■■■■ 4.19
CHMP4B-201ENST00000217402 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.18■■■■■ 4.18
CHMP4B-201ENST00000217402 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.18■■■■■ 4.18
CHMP4B-201ENST00000217402 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.17■■■■■ 4.18
CHMP4B-201ENST00000217402 ADGRL2O95490 1459 aa41.15■■■■■ 4.18
CHMP4B-201ENST00000217402 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.14■■■■■ 4.18
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCA6Q8N139 1617 aa41.13■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 PLXNC1O60486 1568 aa41.11■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.11■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 NCOA1Q15788 1441 aa41.11■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 ROCK1Q13464 1354 aa41.1■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.1■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.1■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 KIF15Q9NS87 1388 aa41.08■■■■■ 4.17
CHMP4B-201ENST00000217402 PCGF6Q9BYE7 350 aa41■■■■■ 4.15
CHMP4B-201ENST00000217402 ATP10AO60312 1499 aa40.99■■■■■ 4.15
CHMP4B-201ENST00000217402 A2MP01023 1474 aa40.97■■■■■ 4.15
CHMP4B-201ENST00000217402 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.96■■■■■ 4.15
CHMP4B-201ENST00000217402 HFM1A2PYH4 1435 aa40.96■■■■■ 4.15
CHMP4B-201ENST00000217402 NAIPQ13075 1403 aa40.94■■■■■ 4.14
CHMP4B-201ENST00000217402 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.92■■■■■ 4.14
CHMP4B-201ENST00000217402 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CHMP4B-201ENST00000217402 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.89■■■■■ 4.14
CHMP4B-201ENST00000217402 REREQ9P2R6 1566 aa40.87■■■■■ 4.13
CHMP4B-201ENST00000217402 ERBINQ96RT1 1412 aa40.85■■■■■ 4.13
CHMP4B-201ENST00000217402 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.83■■■■■ 4.13
CHMP4B-201ENST00000217402 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.82■■■■■ 4.12
CHMP4B-201ENST00000217402 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CHMP4B-201ENST00000217402 KIF3BO15066 747 aa40.76■■■■■ 4.12
CHMP4B-201ENST00000217402 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CHMP4B-201ENST00000217402 AGLP35573 1532 aa40.74■■■■■ 4.11
CHMP4B-201ENST00000217402 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.73■■■■■ 4.11
CHMP4B-201ENST00000217402 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.67■■■■■ 4.1
CHMP4B-201ENST00000217402 MLECQ14165 292 aa40.64■■■■■ 4.1
CHMP4B-201ENST00000217402 GGT6Q6P531 493 aa40.64■■■■■ 4.1
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