RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000086933.2

GSC2-201, Transcript of goosecoid homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GSC2, Length 1,033 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2-201ENST00000086933 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.64■■■■■ 4.58
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GSC2-201ENST00000086933 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.62■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.62■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.59■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.52■■■■■ 4.56
GSC2-201ENST00000086933 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.49■■■■■ 4.55
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GSC2-201ENST00000086933 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
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GSC2-201ENST00000086933 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.43■■■■■ 4.54
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GSC2-201ENST00000086933 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.4■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.39■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.33■■■■■ 4.53
GSC2-201ENST00000086933 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.33■■■■■ 4.53
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GSC2-201ENST00000086933 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.3■■■■■ 4.52
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GSC2-201ENST00000086933 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
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GSC2-201ENST00000086933 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
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GSC2-201ENST00000086933 DAPK1P53355 1430 aa42.27■■■■■ 4.36
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