RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029047.11

Snx16-201, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-201ENSMUST00000029047 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.04■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 Disp1Q3TDN0 1521 aa23.03■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 PxdnQ3UQ28 1475 aa23.02■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abca16E9PWJ7 1678 aa23.02■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.02■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.01■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pkd2O35245 966 aa23.01■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.99■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa22.98■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa22.98■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ncoa3O09000 1398 aa22.96■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zfp644E9QA22 1323 aa22.96■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 SphkapQ6NSW3 1687 aa22.96■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 WrnO09053 1401 aa22.96■■□□□ 1.27
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pik3c2gO70167 1506 aa22.94■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa22.94■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Adcy10Q8C0T9 1614 aa22.92■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.91■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mrs2Q5NCE8 434 aa22.91■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgef11Q68FM7 1552 aa22.91■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm13695A2AK44 830 aa22.91■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Il16O54824 1322 aa22.86■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Washc2Q6PGL7 1334 aa22.86■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 AlkP97793 1621 aa22.85■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.83■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa22.83■■□□□ 1.25
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa22.8■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.8■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Exoc6Q8R313 802 aa22.8■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mbd5B1AYB6 1498 aa22.79■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.77■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abcc2Q8VI47 1543 aa22.77■■□□□ 1.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgap27A2AB59 869 aa22.75■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Map3k4O08648 1597 aa22.75■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.75■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dapk1Q80YE7 1442 aa22.72■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.7■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.7■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.7■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rgl3Q3UYI5 709 aa22.69■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mug2P28666 1451 aa22.69■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa22.69■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Supt16hQ920B9 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.68■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.67■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Naip6Q9JIB6 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mroh2aD3Z750 1679 aa22.66■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.66■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Prex2Q3LAC4 1598 aa22.65■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa22.65■■□□□ 1.22
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rundc1Q0VDN7 615 aa22.64■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Wdr7Q920I9 1489 aa22.62■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Trak1Q6PD31 939 aa22.61■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fam163aQ8CAA5 168 aa22.61■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 P3h3Q8CG70 732 aa22.61■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa22.6■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Myom3A2ABU4 1439 aa22.6■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Card11Q8CIS0 1159 aa22.59■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Caskin1Q6P9K8 1431 aa22.57■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.57■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fmn2Q9JL04 1578 aa22.55■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.52■■□□□ 1.2
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.5■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rock2P70336 1388 aa22.5■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dot1lQ6XZL8 1540 aa22.47■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Asxl1P59598 1514 aa22.45■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.44■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa22.43■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa22.42■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Liat1Q810M6 228 aa22.41■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa22.41■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 PtprgQ05909 1442 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 91 ms