RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.43■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncoa1P70365 1447 aa30.42■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncoa3O09000 1398 aa30.42■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp47Q8BY87 1376 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30.39■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 WrnO09053 1401 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam71e1A1L3C1 212 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.37■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pkd2O35245 966 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SphkapQ6NSW3 1687 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.33■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pik3c2gO70167 1506 aa30.33■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anp32aO35381 247 aa30.32■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Calr4Q3TQS0 420 aa30.32■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfp644E9QA22 1323 aa30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adcy10Q8C0T9 1614 aa30.3■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il16O54824 1322 aa30.28■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtus2Q3UHD3 1353 aa30.27■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa30.26■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AlkP97793 1621 aa30.23■■■□□ 2.43
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc2Q8VI47 1543 aa30.2■■■□□ 2.43
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm13695A2AK44 830 aa30.2■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.19■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30.17■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc24a1Q91WD8 1130 aa30.16■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mbd5B1AYB6 1498 aa30.14■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Washc2Q6PGL7 1334 aa30.13■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mrs2Q5NCE8 434 aa30.12■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa30.09■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap27A2AB59 869 aa30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map3k4O08648 1597 aa30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa30.06■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.05■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Magi1Q6RHR9 1471 aa30.03■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trpm2Q91YD4 1506 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhg5Q66T02 1073 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exoc6Q8R313 802 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh2aD3Z750 1679 aa30■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa30■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam163aQ8CAA5 168 aa29.98■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.98■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mug2P28666 1451 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prex2Q3LAC4 1598 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Naip6Q9JIB6 1403 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NrdcQ8BHG1 1161 aa29.95■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr7Q920I9 1489 aa29.91■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.91■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.9■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.85■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myom3A2ABU4 1439 aa29.85■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rundc1Q0VDN7 615 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trak1Q6PD31 939 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.83■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rtl5Q5DTT4 599 aa29.83■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa29.8■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa29.8■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Card11Q8CIS0 1159 aa29.78■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt16hQ920B9 1047 aa29.78■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa29.75■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rock2P70336 1388 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rusc2Q80U22 1514 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprgQ05909 1442 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Polr3aB2RXC6 1390 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P3h3Q8CG70 732 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Asxl1P59598 1514 aa29.65■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fancd2Q80V62 1450 aa29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.9 ms