RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.43■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncoa1P70365 1447 aa30.42■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncoa3O09000 1398 aa30.42■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp47Q8BY87 1376 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa30.4■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30.39■■■□□ 2.46
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 WrnO09053 1401 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam71e1A1L3C1 212 aa30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.37■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pkd2O35245 966 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SphkapQ6NSW3 1687 aa30.35■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.33■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pik3c2gO70167 1506 aa30.33■■■□□ 2.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anp32aO35381 247 aa30.32■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Calr4Q3TQS0 420 aa30.32■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfp644E9QA22 1323 aa30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30.31■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adcy10Q8C0T9 1614 aa30.3■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il16O54824 1322 aa30.28■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtus2Q3UHD3 1353 aa30.27■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa30.26■■■□□ 2.44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AlkP97793 1621 aa30.23■■■□□ 2.43
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc2Q8VI47 1543 aa30.2■■■□□ 2.43
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm13695A2AK44 830 aa30.2■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.19■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30.17■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc24a1Q91WD8 1130 aa30.16■■■□□ 2.42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mbd5B1AYB6 1498 aa30.14■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Washc2Q6PGL7 1334 aa30.13■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mrs2Q5NCE8 434 aa30.12■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa30.09■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap27A2AB59 869 aa30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map3k4O08648 1597 aa30.08■■■□□ 2.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa30.06■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.05■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Magi1Q6RHR9 1471 aa30.03■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trpm2Q91YD4 1506 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhg5Q66T02 1073 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exoc6Q8R313 802 aa30.01■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh2aD3Z750 1679 aa30■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa30■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.98■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mug2P28666 1451 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29.96■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prex2Q3LAC4 1598 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Naip6Q9JIB6 1403 aa29.95■■■□□ 2.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NrdcQ8BHG1 1161 aa29.95■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr7Q920I9 1489 aa29.91■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.91■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.9■■■□□ 2.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.85■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myom3A2ABU4 1439 aa29.85■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rundc1Q0VDN7 615 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trak1Q6PD31 939 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.83■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rtl5Q5DTT4 599 aa29.83■■■□□ 2.37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa29.8■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa29.8■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Card11Q8CIS0 1159 aa29.78■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt16hQ920B9 1047 aa29.78■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa29.75■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rock2P70336 1388 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rusc2Q80U22 1514 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprgQ05909 1442 aa29.68■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Polr3aB2RXC6 1390 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P3h3Q8CG70 732 aa29.67■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Asxl1P59598 1514 aa29.65■■■□□ 2.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fancd2Q80V62 1450 aa29.65■■■□□ 2.34
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