RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4-201ENSMUST00000025393 NexmifQ5DTT1 1515 aa27.69■■■□□ 2.02
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Smad4-201ENSMUST00000025393 BC005561E9Q5E2 1589 aa27.69■■■□□ 2.02
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Zbtb4Q5F293 982 aa27.42■■□□□ 1.98
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa27.36■■□□□ 1.97
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa27.27■■□□□ 1.96
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ipo9Q91YE6 1041 aa27.27■■□□□ 1.96
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Plcd4Q8K3R3 807 aa27.27■■□□□ 1.96
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa27.26■■□□□ 1.96
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa27.26■■□□□ 1.95
Smad4-201ENSMUST00000025393 Trak1Q6PD31 939 aa27.26■■□□□ 1.95
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Shroom2A2ALU4 1481 aa27.21■■□□□ 1.95
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Rfx7F8VPJ6 1459 aa27.2■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adcy10Q8C0T9 1614 aa27.19■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gm13695A2AK44 830 aa27.19■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Irx3P81067 507 aa27.18■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ttll5Q8CHB8 1328 aa27.18■■□□□ 1.94
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc2Q8VI47 1543 aa27.16■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fhod3Q76LL6 1578 aa27.16■■□□□ 1.94
Smad4-201ENSMUST00000025393 Arhgef11Q68FM7 1552 aa27.14■■□□□ 1.93
Smad4-201ENSMUST00000025393 L3mbtl2P59178 703 aa27.11■■□□□ 1.93
Smad4-201ENSMUST00000025393 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.1■■□□□ 1.93
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Ncoa1P70365 1447 aa27.08■■□□□ 1.93
Smad4-201ENSMUST00000025393 AlkP97793 1621 aa27.08■■□□□ 1.93
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa27.07■■□□□ 1.92
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Smad4-201ENSMUST00000025393 CanxP35564 591 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Map4P27546 1125 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa27.01■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Dapk1Q80YE7 1442 aa27■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pik3c2gO70167 1506 aa26.99■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Card11Q8CIS0 1159 aa26.99■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa26.99■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Neo1P97798 1493 aa26.98■■□□□ 1.91
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa26.98■■□□□ 1.91
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