RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setbp1Q9Z180 1582 aa36,81■■■■□ 3,48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36,8■■■■□ 3,48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhh2Q8C115 1491 aa36,79■■■■□ 3,48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa36,74■■■■□ 3,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP36,72■■■■□ 3,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pkd2O35245 966 aa36,72■■■■□ 3,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP36,71■■■■□ 3,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,7■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp47Q8BY87 1376 aa36,68■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36,66■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtus2Q3UHD3 1353 aa36,66■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc2Q8VI47 1543 aa36,65■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Shroom2A2ALU4 1481 aa36,64■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36,64■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SphkapQ6NSW3 1687 aa36,64■■■■□ 3,46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa36,63■■■■□ 3,45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adcy10Q8C0T9 1614 aa36,62■■■■□ 3,45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP36,61■■■■□ 3,45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36,55■■■■□ 3,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa36,54■■■■□ 3,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa36,54■■■■□ 3,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa36,53■■■■□ 3,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36,52■■■■□ 3,44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il16O54824 1322 aa36,51■■■■□ 3,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc24a1Q91WD8 1130 aa36,51■■■■□ 3,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AlkP97793 1621 aa36,46■■■■□ 3,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa36,45■■■■□ 3,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ncoa1P70365 1447 aa36,44■■■■□ 3,42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pik3c2gO70167 1506 aa36,43■■■■□ 3,42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP36,43■■■■□ 3,42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Magi1Q6RHR9 1471 aa36,41■■■■□ 3,42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36,37■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh2aD3Z750 1679 aa36,36■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif21bQ9QXL1 1668 aa36,35■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prex2Q3LAC4 1598 aa36,35■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP36,34■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36,34■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam163aQ8CAA5 168 aa36,32■■■■□ 3,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36,32■■■■□ 3,4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll5Q8CHB8 1328 aa36,3■■■■□ 3,4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tdrd9Q14BI7 1383 aa36,3■■■■□ 3,4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rgl3Q3UYI5 709 aa36,27■■■■□ 3,4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP36,26■■■■□ 3,4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrs2Q5NCE8 434 aa36,24■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trak1Q6PD31 939 aa36,24■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36,24■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP36,24■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36,23■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36,21■■■■□ 3,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k4O08648 1597 aa36,19■■■■□ 3,38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Calr4Q3TQS0 420 aa36,19■■■■□ 3,38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa36,18■■■■□ 3,38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa36,18■■■■□ 3,38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm13695A2AK44 830 aa36,17■■■■□ 3,38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP36,13■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dapk1Q80YE7 1442 aa36,13■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neo1P97798 1493 aa36,13■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP36,13■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc6Q8R313 802 aa36,12■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rusc2Q80U22 1514 aa36,11■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36,11■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbd5B1AYB6 1498 aa36,11■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Jph4Q80WT0 628 aa36,1■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam71e1A1L3C1 212 aa36,09■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Caskin1Q6P9K8 1431 aa36,08■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpm2Q91YD4 1506 aa36,08■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rundc1Q0VDN7 615 aa36,07■■■■□ 3,37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr7Q920I9 1489 aa36,06■■■■□ 3,36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mug2P28666 1451 aa36,06■■■■□ 3,36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP36,03■■■■□ 3,36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map4P27546 1125 aaKnown RBP36,02■■■■□ 3,36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP36,01■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NrdcQ8BHG1 1161 aa36■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP35,99■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Card11Q8CIS0 1159 aa35,98■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anp32aO35381 247 aa35,97■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plekhg5Q66T02 1073 aa35,96■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AknaQ80VW7 1404 aa35,96■■■■□ 3,35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fancd2Q80V62 1450 aa35,94■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fmn2Q9JL04 1578 aa35,93■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naip6Q9JIB6 1403 aa35,93■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP35,93■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa35,93■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP35,91■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP35,9■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP35,89■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP35,89■■■■□ 3,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP35,84■■■■□ 3,33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myom3A2ABU4 1439 aa35,82■■■■□ 3,33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP35,81■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ssh2Q5SW75 1423 aa35,81■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa35,79■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa35,79■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myt1Q8CFC2 1127 aa35,79■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P3h3Q8CG70 732 aa35,79■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Washc2Q6PGL7 1334 aa35,79■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap5P97393 1501 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dot1lQ6XZL8 1540 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa35,78■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trappc8E9PWG2 1437 aa35,77■■■■□ 3,32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,4 ms