RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 CCT7Q99832 543 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.86□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HFM1A2PYH4 1435 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 MYPNQ86TC9 1320 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SGTAO43765 313 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CD46P15529 392 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HOXD12P35452 270 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 KRT9P35527 623 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 IRAK1P51617 712 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CTAG1AP78358 180 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 PSME1Q06323 249 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SLFN5Q08AF3 891 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 KIF5AQ12840 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 NDUFA5Q16718 116 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HOMER1Q86YM7 354 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 MAML1Q92585 1016 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 DSEQ9UL01 958 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 L1RE1Q9UN81 338 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SQORQ9Y6N5 450 aa6.85□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 ZFYVE9O95405 1425 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 MYO1FO00160 1098 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 PDGFRBP09619 1106 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GHRP10912 638 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CPA3P15088 417 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 ENPP1P22413 925 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HSPA1LP34931 641 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CLCN2P51788 898 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CCNG1P51959 295 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 FUKQ8N0W3 1084 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 GIPC2Q8TF65 315 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HLA-CQ95604 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 ABHD8Q96I13 439 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 HAUS7Q99871 368 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 PICK1Q9NRD5 415 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 LZTS1Q9Y250 596 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 ASB3Q9Y575 518 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 EID1Q9Y6B2 187 aa6.84□□□□□ -1.31
SAMMSON-210ENST00000641260 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 CFAP73A6NFT4 308 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 E7ENQ6 273 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 CHL1O00533 1208 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 SOCS7O14512 581 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC26A4O43511 780 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 IDH3BO43837 385 aa6.83□□□□□ -1.32
SAMMSON-210ENST00000641260 HIP1RO75146 1068 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms