RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB14A6NK59 587 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NOVP48745 357 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ANAPC15P60006 121 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE4BQ07343 736 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA7Q13683 1181 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TKFCQ3LXA3 575 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HIPK3Q9H422 1215 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP39A1Q9NYL5 469 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NMT2O60551 498 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A4P43007 532 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD1Q719H9 257 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MORC4Q8TE76 937 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF2CQ99661 725 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALT4O60513 344 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CABYRO75952 493 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ALAS1P13196 640 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 BECN1Q14457 450 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR12Q9ULL5 1215 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RCSD1Q6JBY9 416 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NAPBQ9H115 298 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOR1O75376 2440 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FGBP02675 491 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC6P62333 389 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB30Q15771 203 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1EQ8WY54 764 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX21Q969T3 373 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 Q9Y3F1 56 aa28.26■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF10AO00220 468 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL23P55773 120 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RABEP1Q15276 862 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA4P34932 840 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB2Q96Q27 587 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IL25Q9H293 177 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MSRAQ9UJ68 235 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 STX8Q9UNK0 236 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 VTA1Q9NP79 307 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 THEGQ9P2T0 379 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RABGGTBP53611 331 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS53Q5VIR6 699 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 TTBK2Q6IQ55 1244 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNB2Q92953 911 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM227BQ96M60 508 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ICAM1P05362 532 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 FGRP09769 529 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOGP15173 224 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 NSMFQ6X4W1 530 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP4K1Q92918 833 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SCLYQ96I15 445 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-216ENST00000628306 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY2A6NKD2 308 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0D9SFI3 127 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 NFIBO00712 420 aa28.19■■■□□ 2.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBP4P22692 258 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A2P36021 539 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN5AQ14524 2016 aa28.18■■■□□ 2.1
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