RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 IGFBP4P22692 258 aa25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 TNFAIP2Q03169 654 aa25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 TLK2Q86UE8 772 aa25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 TTC14Q96N46 770 aa25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ASTN1O14525 1302 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 NEDD4P46934 1319 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 HIP1O00291 1037 aa25.93■■□□□ 1.74
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SRRT-218ENST00000620394 SNHG28P0DPA3 235 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 PDHBP11177 359 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 BEX3Q00994 111 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.93■■□□□ 1.74
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SRRT-218ENST00000620394 MTMR7Q9Y216 660 aa25.93■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ASB14A6NK59 587 aa25.92■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 SNAP25P60880 206 aa25.92■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.92■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.92■■□□□ 1.74
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SRRT-218ENST00000620394 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ZEB2O60315 1214 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 SLC16A2P36021 539 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ZNF543Q08ER8 600 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ESR2Q92731 530 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.9■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 NCOR1O75376 2440 aa25.89■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.89■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 MORC4Q8TE76 937 aa25.89■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.89■■□□□ 1.74
SRRT-218ENST00000620394 ZNF213O14771 459 aa25.88■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.88■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.87■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 GRIN2DO15399 1336 aa25.87■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.86■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 SMPD1P17405 629 aa25.86■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 CCL23P55773 120 aa25.86■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 NSMFQ6X4W1 530 aa25.86■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 PFKMP08237 780 aa25.85■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 PDE4AP27815 886 aa25.85■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.85■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 AAK1Q2M2I8 961 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 IQCA1Q86XH1 822 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 IL25Q9H293 177 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 VTA1Q9NP79 307 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 MYH6P13533 1939 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 ZBBXA8MT70 800 aa25.83■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 PLA2G5P39877 138 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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SRRT-218ENST00000620394 TTC22Q5TAA0 569 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SRRT-218ENST00000620394 RAD50Q92878 1312 aa25.83■■□□□ 1.73
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