RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.49■■□□□ 1.03
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AP2S1-208ENST00000600964 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.49■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 SCN5AQ14524 2016 aa21.49■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AP2S1-208ENST00000600964 CYP2C18P33260 490 aa21.48■■□□□ 1.03
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AP2S1-208ENST00000600964 TMEM199Q8N511 208 aa21.48■■□□□ 1.03
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AP2S1-208ENST00000600964 HERVK_113Q902F9 699 aa21.46■■□□□ 1.03
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AP2S1-208ENST00000600964 B4GALT4O60513 344 aa21.45■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF576Q9H609 170 aa21.45■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.44■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.43■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.42■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 PNMA1Q8ND90 353 aa21.41■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.41■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 TBC1D5Q92609 795 aa21.41■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.41■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.41■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
AP2S1-208ENST00000600964 KDM4AO75164 1064 aa21.4■■□□□ 1.02
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AP2S1-208ENST00000600964 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.39■■□□□ 1.01
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AP2S1-208ENST00000600964 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 SCFD2Q8WU76 684 aa21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 IL25Q9H293 177 aa21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 TRANK1O15050 2925 aa21.39■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 PTPRSQ13332 1948 aa21.38■■□□□ 1.01
AP2S1-208ENST00000600964 HIP1O00291 1037 aa21.38■■□□□ 1.01
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