RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	GBP3	Q9H0R5	595 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	STXBP3	O00186	592 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	EPHX1	P07099	455 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ASGR2	P07307	311 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	NCAM1	P13591	858 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	HTRA3	P83110	453 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	FGD4	Q96M96	766 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	PPM1B	O75688	479 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	MC3R	P41968	323 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP10-2	P60368	255 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	LIPI	Q6XZB0	460 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	LZTR1	Q8N653	840 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	ALG3	Q92685	438 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	GPRASP2	Q96D09	838 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ZNF559-209	ENST00000591652		A0A1B0GTL3	188 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SEPHS1	P49903	392 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	AMPD2	Q01433	879 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CABP7	Q86V35	215 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	JAG2	Q9Y219	1238 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PML	P29590	882 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	GRB10	Q13322	594 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NETO2	Q8NC67	525 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SHD	Q96IW2	340 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	MTA3	Q9BTC8	594 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PAM	P19021	973 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	GJA8	P48165	433 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NFKB2	Q00653	900 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP2R5E	Q16537	467 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CASP7	P55210	303 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC9A5	Q14940	896 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	RTP5	Q14D33	572 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	C7orf72	A4D263	438 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	PLP2	Q04941	152 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	BDH2	Q9BUT1	245 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	NPHS1	O60500	1241 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ZBTB7A	O95365	584 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	ADRB1	P08588	477 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	EFEMP1	Q12805	493 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	VHLL	Q6RSH7	139 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	CARF	Q8N187	725 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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