RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 ALAS1P13196 640 aa22.42■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 NDUFA8P51970 172 aa22.42■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 AP3B2Q13367 1082 aa22.42■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.42■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 MOGSQ13724 837 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 IL17AQ16552 155 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 RESP18Q5W5W9 173 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 CSRNP2Q9H175 543 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 MCTP2Q6DN12 878 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 FERMT2Q96AC1 680 aa22.41■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 NFIBO00712 420 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 TDP2O95551 362 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 POLR2MP0CAP2 368 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 PFKFB1P16118 471 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 RIPK3Q9Y572 518 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 MYPNQ86TC9 1320 aa22.4■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.39■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.39■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.39■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.39■■□□□ 1.18
PGS1-211ENST00000589425 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 GSE1Q14687 1217 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 USP49Q70CQ1 688 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 HPSEQ9Y251 543 aa22.39■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SYCE3A1L190 88 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 NEMFO60524 1076 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 USP11P51784 963 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 OAZ1P54368 228 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 CAMK4Q16566 473 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 POTEDQ86YR6 584 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.38■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ATP2A1O14983 1001 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SLC37A4O43826 429 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SNAPC2Q13487 334 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 PNMA2Q9UL42 364 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 LAD1O00515 517 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SREBF1P36956 1147 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 HSD17B4P51659 736 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ARHGAP4P98171 946 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.37■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 PEX10O60683 326 aa22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ZNF202O95125 648 aa22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 LBX2Q6XYB7 198 aa22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 EPSTI1Q96J88 318 aa22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 ZNF445P59923 1031 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 GHRHRQ02643 423 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MTMR9Q96QG7 549 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 KINO60870 393 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 OR52Z1P0C646 297 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 STAT3P40763 770 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 PRPHP41219 470 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SYKP43405 635 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 PLS1Q14651 629 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 RNF146Q9NTX7 359 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 BTBD7Q9P203 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 COL20A1Q9P218 1284 aa22.35■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.34■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 CYP3A7P24462 503 aa22.34■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.34■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 CALCRLQ16602 461 aa22.33■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PGS1-211ENST00000589425 MBOAT7Q96N66 472 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms