RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF365Q70YC5 407 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF576Q9H609 170 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 PSMC6P62333 389 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF543Q08ER8 600 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 RILPL2Q969X0 211 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 TTC14Q96N46 770 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAF4-216ENST00000586813 IL23AQ9NPF7 189 aa22.77■■□□□ 1.24
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TRAF4-216ENST00000586813 MYH6P13533 1939 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 B4GALT4O60513 344 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 SNHG28P0DPA3 235 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 PBX2P40425 430 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 PBX4Q9BYU1 374 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 PNMA2Q9UL42 364 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 CALML3P27482 149 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.75■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 NEDD4P46934 1319 aa22.75■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 AAMPQ13685 434 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 HERVK_113Q902F9 699 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 SDSP20132 328 aa22.73■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.73■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 SCN5AQ14524 2016 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 CPT1AP50416 773 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 CCL23P55773 120 aa22.72■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF213O14771 459 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 FGBP02675 491 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 EDNRBP24530 442 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 PDE4DQ08499 809 aa22.71■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 DNERQ8NFT8 737 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAF4-216ENST00000586813 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.71■■□□□ 1.23
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TRAF4-216ENST00000586813 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 DGKHQ86XP1 1220 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 MYO9BQ13459 2157 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 TNKSO95271 1327 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 RAD50Q92878 1312 aa22.69■■□□□ 1.22
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TRAF4-216ENST00000586813 KDM4AO75164 1064 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.68■■□□□ 1.22
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TRAF4-216ENST00000586813 IQCA1Q86XH1 822 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 PNMA1Q8ND90 353 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 SCFD2Q8WU76 684 aa22.68■■□□□ 1.22
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TRAF4-216ENST00000586813 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 IGHDP01880 384 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 CYP2C9P11712 490 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAF4-216ENST00000586813 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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