RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 CABP7Q86V35 215 aa21.09■□□□□ 0.97
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SPNS3-204ENST00000575194 RAB34Q9BZG1 259 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-204ENST00000575194 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-204ENST00000575194 SKILP12757 684 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-204ENST00000575194 SLC16A2P36021 539 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-204ENST00000575194 TNFAIP1Q13829 316 aa21.08■□□□□ 0.97
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SPNS3-204ENST00000575194 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
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SPNS3-204ENST00000575194 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 TEPSINQ96N21 525 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.07■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 RRAGCQ9HB90 399 aa21.07■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 POTEDQ86YR6 584 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 STAMQ92783 540 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.06■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 F5H6K3 240 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 GH2P01242 217 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 SLURP2P0DP57 97 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 CDC25AP30304 524 aa21.05■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.05■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 ARID5BQ14865 1188 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 KCND1Q9NSA2 647 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 NDUFB10O96000 172 aa21.04■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 TECP42680 631 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 TRAF1Q13077 416 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 STIM1Q13586 685 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 UBE2SQ16763 222 aa21.04■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 BMP3P12645 472 aa21.03■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 AP3B2Q13367 1082 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 PDIA5Q14554 519 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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SPNS3-204ENST00000575194 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 STK17AQ9UEE5 414 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 TXKP42681 527 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 MAP3K10Q02779 954 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 MED15Q96RN5 788 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-204ENST00000575194 GOPCQ9HD26 462 aa21.02■□□□□ 0.96
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